Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Klhdc3Q8VEM9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Klhdc3Q8VEM9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Klhdc3Q8VEM9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Klhdc3Q8VEM9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Klhdc3Q8VEM9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klhdc3Q8VEM9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc3Q8VEM9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhdc3Q8VEM9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klhdc3Q8VEM9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klhdc3Q8VEM9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klhdc3Q8VEM9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Klhdc3Q8VEM9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Klhdc3Q8VEM9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhdc3Q8VEM9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhdc3Q8VEM9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhdc3Q8VEM9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klhdc3Q8VEM9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klhdc3Q8VEM9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Klhdc3Q8VEM9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Klhdc3Q8VEM9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhdc3Q8VEM9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Klhdc3Q8VEM9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klhdc3Q8VEM9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Klhdc3Q8VEM9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhdc3Q8VEM9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhdc3Q8VEM9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhdc3Q8VEM9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhdc3Q8VEM9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhdc3Q8VEM9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhdc3Q8VEM9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhdc3Q8VEM9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhdc3Q8VEM9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Klhdc3Q8VEM9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc3Q8VEM9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhdc3Q8VEM9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhdc3Q8VEM9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhdc3Q8VEM9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc3Q8VEM9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc3Q8VEM9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhdc3Q8VEM9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhdc3Q8VEM9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhdc3Q8VEM9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhdc3Q8VEM9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhdc3Q8VEM9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhdc3Q8VEM9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc3Q8VEM9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhdc3Q8VEM9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhdc3Q8VEM9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhdc3Q8VEM9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhdc3Q8VEM9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhdc3Q8VEM9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhdc3Q8VEM9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc3Q8VEM9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhdc3Q8VEM9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhdc3Q8VEM9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhdc3Q8VEM9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhdc3Q8VEM9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhdc3Q8VEM9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhdc3Q8VEM9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhdc3Q8VEM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhdc3Q8VEM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhdc3Q8VEM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhdc3Q8VEM9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Klhdc3Q8VEM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc3Q8VEM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc3Q8VEM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc3Q8VEM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc3Q8VEM9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhdc3Q8VEM9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc3Q8VEM9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc3Q8VEM9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhdc3Q8VEM9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhdc3Q8VEM9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhdc3Q8VEM9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhdc3Q8VEM9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc3Q8VEM9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhdc3Q8VEM9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc3Q8VEM9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhdc3Q8VEM9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhdc3Q8VEM9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhdc3Q8VEM9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhdc3Q8VEM9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc3Q8VEM9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc3Q8VEM9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc3Q8VEM9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc3Q8VEM9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc3Q8VEM9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhdc3Q8VEM9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhdc3Q8VEM9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhdc3Q8VEM9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhdc3Q8VEM9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhdc3Q8VEM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhdc3Q8VEM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhdc3Q8VEM9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms