RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	YBL029W	P38201	376 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	AXL1	P40851	1208 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ASE1	P50275	885 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YML6	P51998	286 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ARP9	Q05123	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ARR3	Q06598	404 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	NUS1	Q12063	375 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
CMR3	YPR013C	DBF4	P32325	704 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MTH1	P35198	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	TDP1	P38319	544 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	FMO1	P38866	432 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RFX1	P48743	811 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	VPS75	P53853	264 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MRPL22	P53881	309 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	REG1	Q00816	1014 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ERO1	Q03103	563 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	HOF1	Q05080	669 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ENT4	Q07872	247 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MET17	P06106	444 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PDX1	P16451	410 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	VPS34	P22543	875 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ERG8	P24521	451 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RPC53	P25441	422 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PEP3	P27801	918 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ERG3	P32353	365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	NTH1	P32356	751 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	APE4	P38821	490 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PSD1	P39006	500 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	FLC2	P39719	783 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	FMP10	P40098	244 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ERG5	P54781	538 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RAD30	Q04049	632 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ENB1	Q08299	606 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	TMA16	Q08687	178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	CTI6	Q08923	506 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RCN2	Q12044	265 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	NMD4	Q12129	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	YCK1	P23291	538 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ROX1	P25042	368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	OCA4	P25366	362 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	UBP7	P40453	1071 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	SPO22	P40511	975 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	AAD10	P47182	288 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MRX6	P48564	524 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MUP1	P50276	574 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	SPT20	P50875	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	TAM41	P53230	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	DLT1	Q04216	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MET3	P08536	511 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	YCR061W	P25639	631 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
CMR3	YPR013C	ALY1	P36117	915 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MPS3	P47069	682 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	DSD1	P53095	428 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MUB1	Q03162	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RTN2	Q12443	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	VCX1	Q99385	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	URK1	P27515	501 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	YBR053C	P38235	358 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	REV7	P38927	245 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	SLZ1	P40167	298 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	IRC24	P40580	263 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	UBC11	P52492	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	CRF1	Q04930	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	IZH3	Q07959	543 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	CIR2	Q08822	631 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	CBS1	P14066	229 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	CTP1	P38152	299 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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