RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	SGF29	P25554	259 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	ESL2	P36168	1195 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	YJL163C	P46996	555 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	FCP1	Q03254	732 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	PSR1	Q07800	427 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	IRC13	Q08630	104 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	DAL5	P15365	543 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	YCR061W	P25639	631 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	MRP20	P32387	263 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	TFC3	P34111	1160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	MRPL7	P36519	292 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	FMP52	P40008	231 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	RMD8	P43620	662 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	BUL1	P48524	976 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	ASE1	P50275	885 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	VPS4	P52917	437 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	CDA2	Q06703	312 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	HUA2	Q12134	243 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	HIF1	Q12373	385 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	ABF1	P14164	731 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	TOD6	P34219	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	PHO11	P35842	467 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	YBR225W	P38321	900 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	PHO12	P38693	467 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	FHN1	P53279	174 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	SSL2	Q00578	843 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	REG1	Q00816	1014 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	NUS1	Q12063	375 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	GCN4	P03069	281 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	PRE8	P23639	250 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	NPL6	P32832	435 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	NPR2	P39923	615 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
YVC1	YOR087W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	TAM41	P53230	385 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	MFB1	Q04922	465 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	IRC3	Q06683	689 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	FRE5	Q08908	694 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YVC1	YOR087W	YLR358C	O13565	187 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	FUB1	P25659	250 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	YKL050C	P35736	922 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	TDP1	P38319	544 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	FMP10	P40098	244 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	YSA1	Q01976	231 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	CRF1	Q04930	467 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	MAC1	P35192	417 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	SDH8	P38345	138 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	APE4	P38821	490 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	YJL206C	P39529	758 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	TMA16	Q08687	178 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	VCX1	Q99385	411 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	ERG8	P24521	451 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	ERG4	P25340	473 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	URK1	P27515	501 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	ELF1	P36053	145 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	YBL029W	P38201	376 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	PSD1	P39006	500 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	UBP7	P40453	1071 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	CIR1	P42940	261 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	AAD10	P47182	288 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	MEH1	Q02205	184 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	ATG23	Q06671	453 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YVC1	YOR087W	MLH3	Q12083	715 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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