RNA–Protein interactions for RNA: YMR134W

ERG29, Transcript of Protein of unknown function involved in ergosterol biosynthesis, yeast

Gene ERG29, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ERG29	YMR134W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	EAF5	P39995	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	YAT2	P40017	923 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	PLM2	Q04383	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	RAD34	Q06665	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	VPS8	P39702	1274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	PFA4	Q12006	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	HOS1	Q12214	470 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERG29	YMR134W	RAD26	P40352	1085 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	YIL152W	P40455	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	BOP3	P53958	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	AAT1	Q01802	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	VTC3	Q02725	835 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	YML053C	Q04978	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	ATX2	Q12067	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	LNP1	P38878	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	YNR071C	P53757	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	ARA2	Q04212	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	DSE3	Q08729	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	NDD1	Q08887	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	UBX3	Q12229	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	SCO2	P38072	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	ERV46	P39727	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	MAD2	P40958	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	GSM1	P42950	618 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	IDS2	P46958	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	NIT2	P47016	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	SPC105	P53148	917 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
ERG29	YMR134W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	YCR043C	P25361	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	DIN7	Q12086	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	YCR061W	P25639	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	STL1	P39932	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	RRI1	Q12468	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ERG29	YMR134W	CNA1	P23287	553 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	YPT11	P48559	417 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	SLD3	P53135	668 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	HOL1	P53389	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	MLH2	Q07980	695 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	YAT1	P80235	687 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	GRS2	Q06817	618 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	GSH1	P32477	678 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	UBP7	P40453	1071 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	YJL107C	P42947	387 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	ACS1	Q01574	713 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	TRE2	Q08693	809 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	ORC5	P50874	479 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	YNL144C	P53907	740 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	TRS31	Q03337	283 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	PEX15	Q08215	383 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	VFA1	P40080	203 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	EMP65	P40085	556 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	CRF1	Q04930	467 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	NRT1	Q08485	598 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	PSF3	Q12146	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	MET30	P39014	640 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	YIL169C	P40442	995 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ERG29	YMR134W	ARN1	P38731	627 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ERG29	YMR134W	ERC1	P38767	581 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ERG29	YMR134W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
ERG29	YMR134W	TRI1	Q05024	226 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ERG29	YMR134W	GSH2	Q08220	491 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ERG29	YMR134W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ERG29	YMR134W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ERG29	YMR134W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.45	□□□□□ -1.7

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