RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	MAM1	P40065	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	IDS2	P46958	469 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	COG2	P53271	262 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	SWE1	P32944	819 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	VPS8	P39702	1274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	PCI8	P40512	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	IRC7	P43623	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	SCS3	P53012	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	UBP16	Q02863	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	PSF3	Q12146	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	MAK32	P23060	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	SPC97	P38863	823 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	CIR1	P42940	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	IRC8	P47046	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	ATG16	Q03818	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MGR3	YMR115W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	GAL1	P04385	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	ASK1	P35734	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	RAD26	P40352	1085 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YIL024C	P40543	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YNL058C	P53947	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	UBX4	P54730	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	TRI1	Q05024	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	LCB4	Q12246	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	PIF1	P07271	859 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YUR1	P26725	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	PTP2	P29461	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YKL133C	P36066	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	FTH1	P38310	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	ENT2	Q05785	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YPR089W	O13585	888 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YCR061W	P25639	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	CFD1	P40558	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	PLM2	Q04383	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	MLC2	Q06580	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	TGL1	P34163	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	LNP1	P38878	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	VFA1	P40080	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	TRS31	Q03337	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	VPS72	Q03388	795 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YML053C	Q04978	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	PHO3	P24031	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	DPB3	P27344	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	COQ3	P27680	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	CIN1	P40987	1014 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	ACS1	Q01574	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	RAD34	Q06665	692 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	HER1	Q12276	1246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	NUR1	Q12066	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	HIS6	P40545	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	POL31	P46957	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGR3	YMR115W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	YGR021W	P53212	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	CTT1	P06115	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	ADH4	P10127	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	SDS22	P36047	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MGR3	YMR115W	TAF5	P38129	798 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.8 ms