RNA–Protein interactions for RNA: YMR082C

YMR082C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YMR082C, Length 357 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR082C	YMR082C	SIP4	P46954	829 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	MDE1	P47095	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	SGF73	P53165	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	TNA1	P53322	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	ORC4	P54791	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	RRN5	Q02983	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	SRT1	Q03175	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	RSF1	Q05043	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	AAD4	Q07747	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	HOS1	Q12214	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CHD1	P32657	1468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	BIK1	P11709	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CDC26	P14724	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	SNF5	P18480	905 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YMR082C	YMR082C	POL4	P25615	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	MSP1	P28737	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YEL043W	P32618	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	GCS1	P35197	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	UBP11	P36026	717 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YKL151C	P36059	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CAB2	P40506	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	BST1	P43571	1029 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	SPT20	P50875	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	HFM1	P51979	1187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	NUP84	P52891	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	PUS2	P53167	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	ATG21	Q02887	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	FDC1	Q03034	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YLR358C	O13565	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CLC1	P17891	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	RIT1	P23796	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CWH43	P25618	953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	STB6	P36085	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YBR138C	P38277	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	MEF2	P39677	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	SKP2	P42843	763 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YFL054C	P43549	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	MRX6	P48564	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	EXG2	P52911	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CUL3	P53202	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	MAK10	Q02197	733 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	ROT1	Q03691	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YAP6	Q03935	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	PPN1	Q04119	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	RBA50	Q04418	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	RIM20	Q12033	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	NUS1	Q12063	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	MDY2	Q12285	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	GRX6	Q12438	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CBS1	P14066	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	KAR3	P17119	729 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	CPR2	P23285	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YMR082C	YMR082C	CTS1	P29029	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YMR082C	YMR082C	HSM3	P38348	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	GIC1	P38785	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	BUD16	P39988	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	MAD2	P40958	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	ZIM17	P42844	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	MNT2	P53059	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YGR066C	P53242	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	SPO1	P53541	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	TOF1	P53840	1238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	YSA1	Q01976	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	GCN5	Q03330	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	PLB2	Q03674	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	THI21	Q08975	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR082C	YMR082C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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