RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	RAD26	P40352	1085 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	TDA10	P42938	290 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	COG2	P53271	262 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YNL092W	P53934	400 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	UBX4	P54730	416 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	THI7	Q05998	598 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	ICL2	Q12031	575 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	SWC3	P31376	625 aa		5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	GDA1	P32621	518 aa		5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YNL058C	P53947	316 aa		5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YML122C	Q03207	126 aa		5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YML119W	Q03208	357 aa		5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	RAD33	Q04231	177 aa		5	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	AMD2	P22580	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	RIT1	P23796	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	AAT1	Q01802	451 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	BI2	P03873	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YPT53	P36019	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	ACA1	P39970	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	ORM2	Q06144	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	IRC3	Q06683	689 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	NUP1	P20676	1076 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	PDE1	P22434	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	SIP1	P32578	815 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	SPC72	P39723	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	ATP23	P53722	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	SEG1	Q04279	960 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	SKP2	P42843	763 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	CIR1	P42940	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	RTS3	P53289	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	PLM2	Q04383	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	YML053C	Q04978	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	HRD3	Q05787	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KAR5	YMR065W	APN1	P22936	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	CLB4	P24871	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	GSY2	P27472	705 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	VPS8	P39702	1274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	LCB4	Q12246	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	PTH2	P34222	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	PUG1	P40100	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	SAE2	P46946	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	RIM13	Q03792	727 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	CYK3	Q07533	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	PET122	P10355	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	MSM1	P22438	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	IMA1	P53051	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	MRPL36	P36531	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	BSP1	Q06604	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	SUL2	Q12325	893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	BIK1	P11709	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	BLS1	Q06071	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	NUC1	P08466	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	MDM10	P18409	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	DBF20	P32328	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	PSF2	P40359	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	YAT1	P80235	687 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	TPO3	Q06451	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	BEM3	P32873	1128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	XBP1	P40489	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	BST1	P43571	1029 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	NMD5	P46970	1048 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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