RNA–Protein interactions for RNA: YLR007W

NSE1, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE1, Length 1,011 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE1	YLR007W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	RAD26	P40352	1085 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	ARG2	P40360	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	POL31	P46957	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YGR016W	P53209	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	AAD4	Q07747	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YKL100C	P34248	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YPT10	P38146	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	PMT6	P42934	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	CTR1	P49573	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YNL092W	P53934	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SDH5	Q08230	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SAN1	P22470	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	GMH1	P36125	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	RXT2	P38255	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	PES4	P39684	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	PUG1	P40100	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	MEP1	P40260	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	STU2	P46675	888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	TAM41	P53230	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SPC98	P53540	846 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	BUD17	P53727	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	TAH18	Q12181	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SCM3	Q12334	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	STE12	P13574	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	POL3	P15436	1097 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SIR1	P21691	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	RIT1	P23796	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	CNE1	P27825	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	GLG1	P36143	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	RKM3	P38222	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	BDH2	P39713	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YML122C	Q03207	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	TRI1	Q05024	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	PSR1	Q07800	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
NSE1	YLR007W	PCD1	Q12524	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	ABF1	P14164	731 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	KIN3	P22209	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SLC1	P33333	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	APL3	P38065	1025 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	TDP1	P38319	544 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YLF2	P38746	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	MRPL19	P53875	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	YML119W	Q03208	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	USA1	Q03714	838 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE1	YLR007W	AAD3	P25612	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	DBF4	P32325	704 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	POP2	P39008	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	VFA1	P40080	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	SMK1	P41808	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	TLG1	Q03322	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	STP3	Q05937	343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	IRC10	Q08118	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	PCL8	Q08966	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	HSP42	Q12329	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	SPO16	P17122	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	AAC3	P18238	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	RAD16	P31244	790 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	PAH1	P32567	862 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	IFA38	P38286	347 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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