RNA–Protein interactions for RNA: YKL204W

EAP1, Transcript of eIF4E-associated protein, competes with eIF4G for binding to eIF4E, yeast

Gene EAP1, Length 1,899 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EAP1	YKL204W	YEL068C	P39977	110 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	SDS3	P40505	327 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	PMT6	P42934	759 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	GND2	P53319	492 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	YLR352W	Q06479	807 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	SSM4	P40318	1319 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	RER1	P25560	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	GMH1	P36125	273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	GLG1	P36143	616 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	BUD17	P53727	317 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CTF4	Q01454	927 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	SPC19	Q03954	165 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TAF11	Q04226	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TDA9	Q04545	1251 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TMN2	Q04562	672 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	PNS1	Q12412	539 aa		3.37	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	DPH2	P32461	534 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	MIT1	P40002	666 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	YGR016W	P53209	190 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	ERO1	Q03103	563 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CRD1	Q07560	283 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TRM8	Q12009	286 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	ENT1	Q12518	454 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	KIN3	P22209	435 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CLB4	P24871	460 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	MTH1	P35198	433 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	IFA38	P38286	347 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	BDH2	P39713	417 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TIM44	Q01852	431 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	VID22	Q05934	901 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CTT1	P06115	562 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	BET2	P20133	325 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	RAD16	P31244	790 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	OAR1	P35731	278 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	RIC1	P40395	1056 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CAB2	P40506	365 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	SMK1	P41808	388 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	IRC6	P43615	237 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	IDS2	P46958	469 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	VPS64	Q03944	604 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
EAP1	YKL204W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TAF3	Q12297	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	MTF2	P10849	440 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	MRP7	P12687	371 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	STE12	P13574	688 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	YCL049C	P25577	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CNE1	P27825	502 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	SLC1	P33333	303 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	YMC2	P38087	329 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	TAM41	P53230	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	MRPL19	P53875	158 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	USA1	Q03714	838 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CRF1	Q04930	467 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	SCM3	Q12334	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
EAP1	YKL204W	CYB2	P00175	591 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	NUC1	P08466	329 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	ANP1	P32629	500 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	EMP70	P32802	667 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	YKL050C	P35736	922 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	YPT10	P38146	199 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	MEP1	P40260	492 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	RAD26	P40352	1085 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	PSF2	P40359	213 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	THI6	P41835	540 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	AIM6	Q07716	390 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	PCD1	Q12524	340 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	CDC16	P09798	840 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EAP1	YKL204W	RPC53	P25441	422 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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