RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W DYN3Q04949 312 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W LDB17Q12342 491 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W LSO1Q3E827 93 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data12.95□□□□□ -0.34not detected
SSA4YER103W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SSA4YER103W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SSA4YER103W YJL181WP46987 611 aa12.95□□□□□ -0.34
SSA4YER103W HST2P53686 357 aa12.95□□□□□ -0.34
SSA4YER103W PEX15Q08215 383 aa12.95□□□□□ -0.34
SSA4YER103W KCS1Q12494 1050 aa12.95□□□□□ -0.34
SSA4YER103W CAR1P00812 333 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RHO1P06780 209 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W KSS1P14681 368 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W HSP60P19882 572 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W VAC17P25591 423 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W ACH1P32316 526 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W CST26P38226 397 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W YBR259WP38338 688 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RMR1P53060 241 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W LOT6Q07923 191 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W SOG2Q08817 791 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W HER1Q12276 1246 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RSR1P13856 272 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W SSE2P32590 693 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W YPK3P38070 525 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W BZZ1P38822 633 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W URC2Q04411 772 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W LAP2Q10740 671 aa12.94□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RPN13O13563 156 aa12.93□□□□□ -0.34
SSA4YER103W MEI4P29467 408 aa12.93□□□□□ -0.34
SSA4YER103W PEX5P35056 612 aa12.93□□□□□ -0.34
SSA4YER103W PCM1P38628 557 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
SSA4YER103W VHR1P40522 640 aa12.93□□□□□ -0.34
SSA4YER103W VTC4P47075 721 aa12.93□□□□□ -0.34
SSA4YER103W ECM3Q99252 613 aa12.93□□□□□ -0.34
SSA4YER103W NHA1Q99271 985 aa12.93□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RET1P22276 1149 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W CYS4P32582 507 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W DOM34P33309 386 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W CKB2P38930 258 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W YCS4Q06156 1176 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W ENT4Q07872 247 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RGS2Q99188 309 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W AMS1P22855 1083 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W MSH2P25847 964 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W DLD3P39976 496 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W NPP2P39997 493 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W COP1P53622 1201 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W PHM6Q05637 104 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RSA1Q08932 381 aa12.92□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RAD18P10862 487 aa12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W SEC1P30619 724 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W MUM2P38236 366 aa12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W ECM10P39987 644 aa12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RPN11P43588 306 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RCN2Q12044 265 aa12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W MNL2Q12205 849 aa12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
SSA4YER103W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data12.9□□□□□ -0.34not detected
SSA4YER103W YER152CP10356 443 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W RAP1P11938 827 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W CTR86P25355 563 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W VMA6P32366 345 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W NGG1P32494 702 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W YRB2P40517 327 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W AGP3P43548 558 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W IRC6P43615 237 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W NMA111P53920 997 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W TAF11Q04226 346 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W NTG2Q08214 380 aa12.9□□□□□ -0.34
SSA4YER103W KIN1P13185 1064 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PMA2P19657 947 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W FAR1P21268 830 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W POL4P25615 582 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PHA2P32452 334 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W DUR3P33413 735 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ATG19P35193 415 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W FCY21P40039 528 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SNZ3P43545 298 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YFL040WP43562 540 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PSP2P50109 593 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GPI1P53306 609 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SNZ2P53824 298 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YNL058CP53947 316 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W REX2P54964 269 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SVF1Q05515 481 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GAS5Q08193 484 aa12.9□□□□□ -0.35
SSA4YER103W HMG2P12684 1045 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W VPS3P23643 1011 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W URA10P30402 227 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YKU70P32807 602 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W WHI3P34761 661 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
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