RNA–Protein interactions for RNA: YDR385W

EFT2, Transcript of Elongation factor 2 (EF-2), also encoded by EFT1, yeast

Gene EFT2, Length 2,529 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFT2	YDR385W	VPS34	P22543	875 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	LYP1	P32487	611 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	TFB1	P32776	642 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ATG32	P40458	529 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	FMP32	P43557	207 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	IVY1	Q04934	453 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	MHR1	Q06630	226 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	not detected
EFT2	YDR385W	GTT2	Q12390	233 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	NSI1	Q12457	570 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	STE3	P06783	470 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	KIN1	P13185	1064 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	RGR1	P19263	1082 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	TFC1	P32367	649 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	CCL1	P37366	393 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YBR032W	P38223	100 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	TRM5	P38793	499 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	EMP65	P40085	556 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YGR237C	P50089	785 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	DSD1	P53095	428 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	LSC2	P53312	427 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	NIS1	P53939	407 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	NSE5	Q03718	556 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ARP10	Q04549	284 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YPD1	Q07688	167 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	COR1	P07256	457 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	HO	P09932	586 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	PRI1	P10363	409 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	SPO11	P23179	398 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ATG22	P25568	528 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	PMT2	P31382	759 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	NIC96	P34077	839 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ETR1	P38071	380 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	RCK2	P38623	610 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YAP5	P40574	245 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	FET5	P43561	622 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	NMD5	P46970	1048 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YJR098C	P47139	656 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	SPO77	Q06134	477 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	BRE4	Q07660	1125 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YAP7	Q08182	245 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ATG31	Q12421	196 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	TSC13	Q99190	310 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	VMR1	P38735	1592 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	AAD3	P25612	363 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	NAT2	P37293	288 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	AIM2	P39721	246 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	PIG2	P40187	538 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ROG3	P43602	733 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	MRPL13	Q02204	264 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	VHS1	Q03785	461 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	GMC2	Q06201	188 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	REX3	Q12090	404 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YOR131C	Q12486	218 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	HOM3	P10869	527 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	CIN8	P27895	1000 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YAT2	P40017	923 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	SAS4	Q04003	481 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YEH1	Q07804	573 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YPL191C	Q08930	360 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	RAD59	Q12223	238 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ATG34	Q12292	412 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ZRT2	Q12436	422 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	SKM1	Q12469	655 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	PUT2	P07275	575 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	PPQ1	P32945	549 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	RPC25	P35718	212 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	VFA1	P40080	203 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	HPM1	P40481	377 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	IRC5	P43610	853 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	SAP4	P53036	818 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YNL115C	P53925	644 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFT2	YDR385W	YDR476C	Q03362	224 aa		6.24	□□□□□ -1.41

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