RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	HPM1	P40481	377 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	VTC4	P47075	721 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DSD1	P53095	428 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YGR016W	P53209	190 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YAF9	P53930	226 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RRN5	Q02983	363 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SRT1	Q03175	343 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	BRE4	Q07660	1125 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	FRA1	Q07825	749 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	FMP16	Q12497	93 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	VCX1	Q99385	411 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MRP13	P12686	339 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	VAM7	P32912	316 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PPQ1	P32945	549 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	KTR2	P33550	425 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YET1	P35723	206 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ERT1	P38140	529 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GOS1	P38736	223 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	EPS1	P40557	701 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RET2	P43621	546 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SIW14	P53965	281 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SED5	Q01590	340 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	OSH6	Q02201	448 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MUK1	Q02866	612 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GRC3	Q07845	632 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SSP2	Q08646	371 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PHM7	Q12252	991 aa		3.68	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CCP1	P00431	361 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	AAD3	P25612	363 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DAL80	P26343	269 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PEX3	P28795	441 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	TFC1	P32367	649 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	APM3	P38153	483 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SLM4	P38247	162 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YMR262W	P38430	313 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SOH1	P38633	127 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YGR210C	P42942	411 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YFR018C	P43599	363 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	COX16	P47081	118 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ABM1	P47146	123 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MNT2	P53059	558 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DAM1	P53267	343 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CAF40	P53829	373 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.67	□□□□□ -1.82	not detected
XRS2	YDR369C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SSY1	Q03770	852 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SOV1	Q04748	898 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ECI1	Q05871	280 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YLR407W	Q06070	228 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SPO77	Q06134	477 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	VTA1	Q06263	330 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ENV9	Q08651	330 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.67	□□□□□ -1.82	not detected
XRS2	YDR369C	ARP7	Q12406	477 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ATG31	Q12421	196 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RAD61	Q99359	647 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GAL1	P04385	528 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PBS2	P08018	668 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	HSF1	P10961	833 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	AEP2	P22136	580 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MRM1	P25270	412 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	BDF1	P35817	686 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CAF4	P36130	643 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YBR032W	P38223	100 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	TRM5	P38793	499 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	LNP1	P38878	278 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	COS4	P43542	379 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	FET5	P43561	622 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	NMD5	P46970	1048 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	COS5	P47187	383 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MSE1	P48525	536 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	TOM22	P49334	152 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	NIT3	P49954	291 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	COS1	P53822	381 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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