RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W ATP4P05626 244 aa3.82□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YNL058CP53947 316 aa3.82□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W HRD3Q05787 833 aa3.82□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YMR085WP0CF18 432 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YPK1P12688 680 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YLF2P38746 405 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W CFD1P40558 293 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W GSM1P42950 618 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W IRC7P43623 340 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.81□□□□□ -1.8not detected
NSE4YDL105W MET14Q02196 202 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W MLC2Q06580 163 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YOL057WQ08225 711 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data3.81□□□□□ -1.8not detected
NSE4YDL105W ARP7Q12406 477 aa3.81□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W CTT1P06115 562 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W PTP2P29461 750 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W MGM1P32266 881 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W VFA1P40080 203 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YIL024CP40543 189 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W IDS2P46958 469 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W NUP53Q03790 475 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W IOC4Q04213 475 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W HER1Q12276 1246 aa3.8□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W GAL1P04385 528 aa3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W ADH4P10127 382 aa3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W SWD1P39706 426 aa3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W HIS6P40545 261 aa3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W COS12P53053 380 aa3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W CYK3Q07533 885 aa3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W CRD1Q07560 283 aa3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YOL114CQ12322 202 aa3.79□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W CDC5P32562 705 aa3.78□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W GCS1P35197 352 aa3.78□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W STB5P38699 743 aa3.78□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W YJR008WP47085 338 aa3.78□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W TEP1P53916 434 aa3.78□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
NSE4YDL105W CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YER190C-BP0CX94 160 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YEL077W-AP0CX95 160 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YGR296C-BP0CX96 160 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YPL283W-BP0CX97 160 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YPR204C-AP0CX98 160 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W SDH8P38345 138 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W LNP1P38878 278 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W VPS27P40343 622 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W IMA5P40884 581 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W PAP2P53632 584 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W TRS31Q03337 283 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W VPS64Q03944 604 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W AAD4Q07747 329 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YOR111WQ99210 232 aa3.77□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W MSH1P25846 959 aa3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W COQ3P27680 312 aa3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W MAF1P41910 395 aa3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W QRI7P43122 407 aa3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W POL31P46957 487 aa3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W ACS1Q01574 713 aa3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W RAD33Q04231 177 aa3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W LAS21P40367 830 aa3.75□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W CIR1P42940 261 aa3.75□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W MAD3P47074 515 aa3.75□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YNL092WP53934 400 aa3.75□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W PHO81P17442 1178 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W PRE2P30656 287 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W GDA1P32621 518 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W APM3P38153 483 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W FTH1P38310 465 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W STT3P39007 718 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YAT2P40017 923 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W MAM1P40065 302 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W RAD26P40352 1085 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W COG2P53271 262 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W ARA2Q04212 335 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W HIM1Q06674 414 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W BUD7Q08754 746 aa3.74□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W PIF1P07271 859 aa3.73□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W MSS18P08593 268 aa3.73□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W MIS1P09440 975 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W SIR1P21691 654 aa3.73□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YCR061WP25639 631 aa3.73□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W ATO2P32907 282 aa3.73□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W YHL041WP38730 149 aa3.73□□□□□ -1.81
NSE4YDL105W MTG2P38860 518 aa3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.5 ms