RNA–Protein interactions for RNA: YBR215W

HPC2, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HPC2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPC2	YBR215W	HXT4	P32467	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	AFG2	P32794	780 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	GPT2	P36148	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	ERT1	P38140	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	IFA38	P38286	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	YMR262W	P38430	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	PSD1	P39006	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	SCC4	P40090	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	APS3	P47064	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	ALT1	P52893	592 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	COQ6	P53318	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	SNA4	Q07549	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	DCS2	Q12123	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.61	not detected
HPC2	YBR215W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	MEI4	P29467	408 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	LOH1	P47055	219 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	SSN8	P47821	323 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	TIM21	P53220	239 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	SNO4	Q04902	237 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	HSP32	Q08992	237 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	ULA1	Q12059	462 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	MED4	Q12343	284 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HPC2	YBR215W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YAK1	P14680	807 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PRE8	P23639	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	RER2	P35196	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GLG1	P36143	616 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	MRPL37	P36532	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PPE1	P38796	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PUG1	P40100	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	MPS3	P47069	682 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	CTF18	P49956	741 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	TAD1	P53065	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YNL115C	P53925	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GTO3	Q04806	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	FMP45	Q07651	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GUP2	Q08929	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	ICL2	Q12031	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GPA1	P08539	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	RSR1	P13856	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	UTR1	P21373	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SEC62	P21825	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	CLB4	P24871	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	ADP1	P25371	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	NTH2	P35172	780 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	WSS1	P38838	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PEX28	P38848	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	LYS9	P38999	446 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	ALG5	P40350	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	CEP3	P40969	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	NET1	P47035	1189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	ALT2	P52892	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	BET4	Q00618	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	RNT1	Q02555	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	NHX1	Q04121	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SPC24	Q04477	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	VPS38	Q05919	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	CSC1	Q06538	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	ISN1	Q99312	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SEC63	P14906	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GID7	P25569	745 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	CSE1	P33307	960 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	STE13	P33894	931 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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