RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	MTF2	P10849	440 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	WHI2	P12611	486 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YCL049C	P25577	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CWH43	P25618	953 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MCM10	P32354	571 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	BEM3	P32873	1128 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SPC72	P39723	622 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YEL025C	P39991	1188 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SMK1	P41808	388 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	ERR3	P42222	437 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MAD3	P47074	515 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SAP4	P53036	818 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MNT2	P53059	558 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	PEF1	P53238	335 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MDM1	Q01846	1127 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	AIM41	Q12032	185 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	AQY1	P0CD91	305 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CBP3	P21560	335 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SIR1	P21691	654 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MRPL36	P36531	177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CCL1	P37366	393 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	NPR3	P38742	1146 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MAD2	P40958	196 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	GLO1	P50107	326 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CRD1	Q07560	283 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	FRE7	Q12333	620 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	INH1	P01097	85 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	NUP1	P20676	1076 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	VPS33	P20795	691 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SLC1	P33333	303 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YJL193W	P39542	402 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	EXO1	P39875	702 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	XBP1	P40489	647 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	IMA5	P40884	581 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YFL015C	P43578	164 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MEP3	P53390	489 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YNR071C	P53757	342 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	DIN7	Q12086	430 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	HOS1	Q12214	470 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	NUC1	P08466	329 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	PTP1	P25044	335 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	RPC34	P32910	317 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	TDA10	P42938	290 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	BST1	P43571	1029 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	NET1	P47035	1189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	IMA1	P53051	589 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SPC19	Q03954	165 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	AAD4	Q07747	329 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YAP7	Q08182	245 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
AIM4	YBR194W	YDR056C	Q12025	205 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	TGS1	Q12052	315 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MED1	Q12321	566 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	BIK1	P11709	440 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	POL3	P15436	1097 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	GSY2	P27472	705 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	LOT5	P34234	306 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	UME6	P39001	836 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	PUG1	P40100	303 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CTF18	P49956	741 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MDR1	P53258	950 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YNL092W	P53934	400 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	ARA2	Q04212	335 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	VID22	Q05934	901 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	PCL8	Q08966	492 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	AAC1	P04710	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	PCK1	P10963	549 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CLB4	P24871	460 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	RAD16	P31244	790 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	PSF2	P40359	213 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	NMD5	P46970	1048 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	TFC6	Q06339	672 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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