RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 CALML4Q96GE6 196 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 NWD1Q149M9 1564 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 NTSR2O95665 410 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PRKG1Q13976 671 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 LUZP1Q86V48 1076 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PLA2G12BQ9BX93 195 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 GPSM2P81274 684 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 LETM2Q2VYF4 491 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 NEDD4P46934 1319 aa11.82□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF609O15014 1411 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CSF1RP07333 972 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TMC6Q7Z403 805 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 A0A0G2JLW4 131 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CYP2D6P10635 497 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 NIM1KQ8IY84 436 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 RAB34Q9BZG1 259 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SLIT3O75094 1523 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 OFD1O75665 1012 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 BBOX1O75936 387 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CHMP4BP1P59074 171 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 FANCBQ8NB91 859 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CALML3P27482 149 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CLRN2A0PK11 232 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SEMA3EO15041 775 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 USH1GQ495M9 461 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TMX1Q9H3N1 280 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CYB5R4Q7L1T6 521 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 USP28Q96RU2 1077 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SAMM50Q9Y512 469 aa11.8□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CUL4AQ13619 759 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PLS1Q14651 629 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TAF6LQ9Y6J9 622 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 AIFM3Q96NN9 605 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 LIG1P18858 919 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 APOA5Q6Q788 366 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CLIC4Q9Y696 253 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 DLGAP5Q15398 846 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TNS2Q63HR2 1409 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 BCL9O00512 1426 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 C21orf2O43822 256 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 STX17P56962 302 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TNIP1Q15025 636 aa11.79□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 NPR1P16066 1061 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PNMA1Q8ND90 353 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CNKSR1Q969H4 720 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 RAD17O75943 681 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CACNB3P54284 484 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 MNS1Q8NEH6 495 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CEP89Q96ST8 783 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 NR1I2O75469 434 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 KLRK1P26718 216 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 USP17L3A6NCW0 530 aa11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 USP17L4A6NCW7 530 aa11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 KANK3Q6NY19 840 aa11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
TTPAL-201ENST00000262605 NMT2O60551 498 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-201ENST00000262605 GNA11P29992 359 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-201ENST00000262605 TTC38Q5R3I4 469 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-201ENST00000262605 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-201ENST00000262605 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms