RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dmrtc2Q8CGW9 370 aa9.34□□□□□ -0.91
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Olfr975Q8VG91 310 aa9.34□□□□□ -0.91
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bub3Q9WVA3 326 aa9.34□□□□□ -0.91
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv8-8A0A0A6YXQ0 119 aa9.34□□□□□ -0.91
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10188Q3V432 135 aa9.34□□□□□ -0.91
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Omt2bD3YX29 119 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm7075D3Z497 112 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Reg3gO09049 174 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Them7Q9DCP4 223 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tcrg-V4A0A0B4J1J8 138 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm5089A1L3C8 106 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01794 123 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PmvkQ9D1G2 192 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem141A2AJB2 108 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Atp6v0bQ91V37 205 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mrpl20Q9CQL4 149 aa9.33□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav14-3A0A075B607 120 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm2564F6Z9S8 108 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm11020F6ZGD5 61 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccl19O70460 108 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P04944 107 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pla2g2cP48076 150 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Il1f10Q8R459 152 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cxcl14Q9WUQ5 99 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Spcs1Q9D958 161 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zfand3Q497H0 227 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ifitm10Q8BR26 201 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PtprqP0C5E4 2300 aa9.32□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igkv4-57A0A0A6YYE7 117 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4930447F04RikA2AFR2 126 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm6812B1AXU1 112 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gp9O88186 177 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav3-3Q5R1C3 114 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Htr1dQ61224 374 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccl24Q9JKC0 119 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam110dQ80X91 271 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rab37Q9JKM7 223 aa9.31□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ss18Q62280 418 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lyrm7Q9DA03 104 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mrps12O35680 139 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zcwpw2Q08EN7 125 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm12689Q8BQU9 117 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm21060J3KMU4 56 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem89Q9DA04 169 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Phlda3Q9WV95 125 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Col4a2P08122 1707 aa9.3□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gpx1P11352 201 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Samd10Q7TST3 202 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm5294J3QP53 216 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 ColqO35348 457 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01739 132 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf575Q3TXZ1 239 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PolP10400 120 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plekhb2Q9QZC7 221 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ubr5Q80TP3 2792 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm33815A0A087WNV3 176 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cited2O35740 269 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Foxc2Q61850 494 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rasl10aQ8K5A4 203 aa9.29□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm17430F6RSK3 157 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01811 117 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 UrahQ9CRB3 118 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Smim10l1A0A087WNQ7 89 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Snx22Q8C084 192 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gtf2h5Q8K2X8 71 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Muc2Q80Z19 2680 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Leap2Q91V13 76 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 OtorQ9JIE3 128 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PerpQ9JK95 193 aa9.28□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sdhaf1Q3U276 118 aa9.27□□□□□ -0.92
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nat8b-psE0CYC6 232 aa9.27□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01750 117 aa9.27□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa9.27□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cd33Q63994 403 aa9.27□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bles03Q8VD62 251 aa9.27□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Iah1Q9DB29 249 aa9.27□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nit2Q9JHW2 276 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 FlnaQ8BTM8 2647 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm94Q3V2D2 93 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm5941Q497P9 117 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CrygcQ61597 174 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tomm7Q9D173 55 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Akap9Q70FJ1 3797 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52 ms