Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD62

Bles03, UPF0696 protein C11orf68 homolog, mousemouse

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bles03Q8VD62 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Bles03Q8VD62 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bles03Q8VD62 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bles03Q8VD62 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Bles03Q8VD62 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bles03Q8VD62 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bles03Q8VD62 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bles03Q8VD62 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bles03Q8VD62 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bles03Q8VD62 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bles03Q8VD62 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bles03Q8VD62 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bles03Q8VD62 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bles03Q8VD62 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bles03Q8VD62 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bles03Q8VD62 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bles03Q8VD62 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bles03Q8VD62 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bles03Q8VD62 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bles03Q8VD62 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bles03Q8VD62 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bles03Q8VD62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bles03Q8VD62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bles03Q8VD62 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bles03Q8VD62 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bles03Q8VD62 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bles03Q8VD62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bles03Q8VD62 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bles03Q8VD62 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bles03Q8VD62 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Bles03Q8VD62 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bles03Q8VD62 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bles03Q8VD62 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bles03Q8VD62 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bles03Q8VD62 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bles03Q8VD62 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bles03Q8VD62 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bles03Q8VD62 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bles03Q8VD62 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bles03Q8VD62 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bles03Q8VD62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bles03Q8VD62 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bles03Q8VD62 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bles03Q8VD62 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bles03Q8VD62 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Bles03Q8VD62 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bles03Q8VD62 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bles03Q8VD62 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bles03Q8VD62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bles03Q8VD62 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bles03Q8VD62 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bles03Q8VD62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bles03Q8VD62 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bles03Q8VD62 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bles03Q8VD62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bles03Q8VD62 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bles03Q8VD62 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bles03Q8VD62 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bles03Q8VD62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bles03Q8VD62 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bles03Q8VD62 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bles03Q8VD62 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bles03Q8VD62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bles03Q8VD62 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bles03Q8VD62 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bles03Q8VD62 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bles03Q8VD62 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bles03Q8VD62 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bles03Q8VD62 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bles03Q8VD62 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bles03Q8VD62 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bles03Q8VD62 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bles03Q8VD62 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bles03Q8VD62 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bles03Q8VD62 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bles03Q8VD62 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bles03Q8VD62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bles03Q8VD62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bles03Q8VD62 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bles03Q8VD62 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Bles03Q8VD62 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Bles03Q8VD62 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bles03Q8VD62 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bles03Q8VD62 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bles03Q8VD62 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bles03Q8VD62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bles03Q8VD62 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bles03Q8VD62 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bles03Q8VD62 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bles03Q8VD62 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bles03Q8VD62 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bles03Q8VD62 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bles03Q8VD62 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bles03Q8VD62 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bles03Q8VD62 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Bles03Q8VD62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bles03Q8VD62 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bles03Q8VD62 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bles03Q8VD62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bles03Q8VD62 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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