Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
P04944 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
P04944 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
P04944 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
P04944 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
P04944 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
P04944 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
P04944 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
P04944 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
P04944 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
P04944 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
P04944 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
P04944 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
P04944 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
P04944 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
P04944 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
P04944 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
P04944 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
P04944 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
P04944 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
P04944 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
P04944 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P04944 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P04944 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P04944 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
P04944 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
P04944 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
P04944 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
P04944 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
P04944 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,56■■□□□ 1,36
P04944 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
P04944 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,47■■□□□ 1,35
P04944 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
P04944 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
P04944 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
P04944 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
P04944 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
P04944 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
P04944 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
P04944 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
P04944 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
P04944 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
P04944 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
P04944 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
P04944 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
P04944 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1,27
P04944 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,99■■□□□ 1,27
P04944 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
P04944 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
P04944 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
P04944 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
P04944 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
P04944 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
P04944 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
P04944 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,47■■□□□ 1,19
P04944 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
P04944 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
P04944 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
P04944 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
P04944 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
P04944 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
P04944 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
P04944 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
P04944 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
P04944 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
P04944 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
P04944 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
P04944 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
P04944 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,11■■□□□ 1,13
P04944 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
P04944 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
P04944 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
P04944 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
P04944 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,06■■□□□ 1,12
P04944 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
P04944 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
P04944 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
P04944 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
P04944 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
P04944 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
P04944 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
P04944 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
P04944 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,89■■□□□ 1,09
P04944 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
P04944 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
P04944 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
P04944 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,09
P04944 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
P04944 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
P04944 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
P04944 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
P04944 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,78■■□□□ 1,08
P04944 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
P04944 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
P04944 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P04944 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
P04944 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P04944 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P04944 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P04944 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
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