RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4-203ENST00000409212 MT3P25713 68 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF213Q63HN8 5207 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4-203ENST00000409212 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4-203ENST00000409212 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4-203ENST00000409212 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4-203ENST00000409212 MT4P47944 62 aa4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4-203ENST00000409212 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4-203ENST00000409212 MT1AP04731 61 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4-203ENST00000409212 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4-203ENST00000409212 PRM1P04553 51 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4-203ENST00000409212 MUC2Q02817 5179 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE1DQ5T752 114 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.44□□□□□ -1.7
SH3BP4-203ENST00000409212 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.44□□□□□ -1.7
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.42□□□□□ -1.7
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.42□□□□□ -1.7
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.42□□□□□ -1.7
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.38□□□□□ -1.71
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP4-203ENST00000409212 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE4AQ5TA78 99 aa4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4-203ENST00000409212 USH2AO75445 5202 aa4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4-203ENST00000409212 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SH3BP4-203ENST00000409212 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-9P26371 169 aa3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE1CQ5T751 118 aa3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE1EQ5T753 118 aa3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE1FQ5T754 118 aa3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4-203ENST00000409212 KMT2DO14686 5537 aa3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4-203ENST00000409212 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4-203ENST00000409212 SSPOA2VEC9 5147 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP4-203ENST00000409212 NEBP20929 6669 aa3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4-203ENST00000409212 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4-203ENST00000409212 MDN1Q9NU22 5596 aa3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.61□□□□□ -1.83
SH3BP4-203ENST00000409212 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4-203ENST00000409212 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.4□□□□□ -1.86
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.16□□□□□ -1.9
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.14□□□□□ -1.91
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.14□□□□□ -1.91
SH3BP4-203ENST00000409212 MUC5ACP98088 5654 aa2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4-203ENST00000409212 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4-203ENST00000409212 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-8O75690 187 aa2.69□□□□□ -1.98
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.63□□□□□ -1.99
SH3BP4-203ENST00000409212 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4-203ENST00000409212 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4-203ENST00000409212 PHGR1C9JFL3 82 aa2.35□□□□□ -2.03
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2□□□□□ -2.09
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4-203ENST00000409212 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.43□□□□□ -2.18
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