RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041055.8

Atg2b-201, Transcript of Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg2b, Length 7,546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CtsbP10605 339 aa10.01□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Loxl1P97873 607 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Znrd1Q791N7 123 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ep300B2RWS6 2412 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ube2bP63147 152 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm815Q3UWS2 115 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Defa21Q8C1P2 93 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 8030423J24RikQ9CX45 142 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 P18528 98 aa10□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mapk1ip1Q9D7G9 263 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 H2al1jA2BFR3 109 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ndufs7Q9DC70 224 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fxyd1Q9Z239 92 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fgf4P11403 202 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Greb1Q3UHK3 1954 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Igkv4-74A0A0B4J1I3 119 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Bcl6bO88282 474 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Znf787Q8BIF9 381 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Atp6v0bQ91V37 205 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm21370Q3T9V6 190 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Smim26Q3V460 107 aa9.99□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 SelenokQ9JLJ1 94 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm20379A0A087WR34 119 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 P01787 123 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ppp1r32Q148A4 427 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lyrm9Q3UN90 78 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Psmb11Q8BG41 302 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rnf183Q8QZS5 190 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Notch3Q61982 2318 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 P03980 138 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cox11Q6P8I6 275 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prr3Q811B5 190 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Morn3Q8C5T4 241 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 AmelxP63277 210 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 LeprotO89013 131 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 MdfiP70331 251 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tm4sf20Q9CQY8 226 aa9.98□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rnf144bQ8BKD6 301 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ss18l2Q9D174 77 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rs1Q9Z1L4 224 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm7102J3QQ10 178 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GrnP28798 589 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm10767Q3TQP0 103 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gemin7Q9CWY4 129 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Shisal2aA2A9G7 189 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 SeboxP70368 190 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trav7-2Q5R1I3 112 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Samd5Q3V1H9 173 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Synj2bpQ9D6K5 145 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GfyJ3KML8 504 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 P01790 122 aa9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Q80X32 188 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prok2Q9QXU7 128 aa9.96□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gdf15Q9Z0J7 303 aa9.96□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Inafm1E9PV59 130 aa9.96□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm26727M0QWT1 121 aa9.96□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Reg3gO09049 174 aa9.96□□□□□ -0.81
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Reg3dQ9QUS9 175 aa9.96□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 F5O88783 2183 aa9.96□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ndufc2Q9CQ54 120 aa9.96□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Klk11Q9QYN3 276 aa9.96□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 3110021N24RikJ3QMN2 152 aa9.96□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Polr3kQ9CQZ7 108 aa9.96□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 BC035044E0CXF8 138 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 HampQ9EQ21 83 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 KprpB2RUR4 657 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CckP09240 115 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 9130213A22RikQ3V3T2 120 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zcwpw2Q08EN7 125 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prok1Q14A28 105 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm10604Q3V0X7 143 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm20499D3Z4G5 72 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem210Q9D2F0 147 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccl24Q9JKC0 119 aa9.95□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm9961Q8BNV2 113 aa9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mbd6Q3TY92 1003 aa9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Dand5Q76LW6 185 aa9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 9430097D07RikQ8BS47 195 aa9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prr12E9PYL2 2035 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Arhgap21Q6DFV3 1944 aa9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 4930447F04RikA2AFR2 126 aa9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tcf24V9GWT9 166 aa9.94□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Usf3B2RUQ2 2221 aa9.93□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa9.93□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zc2hc1aQ8BJH1 324 aa9.93□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa9.93□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 P04945 108 aa9.93□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Hist2h2beQ64524 126 aa9.93□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pcnx2Q5DU28 2122 aa9.93□□□□□ -0.82
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cspg4Q8VHY0 2327 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.3 ms