Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z239

Fxyd1, Phospholemman, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fxyd1Q9Z239 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fxyd1Q9Z239 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fxyd1Q9Z239 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fxyd1Q9Z239 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fxyd1Q9Z239 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fxyd1Q9Z239 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fxyd1Q9Z239 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fxyd1Q9Z239 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fxyd1Q9Z239 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fxyd1Q9Z239 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fxyd1Q9Z239 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fxyd1Q9Z239 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fxyd1Q9Z239 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fxyd1Q9Z239 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fxyd1Q9Z239 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fxyd1Q9Z239 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fxyd1Q9Z239 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fxyd1Q9Z239 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fxyd1Q9Z239 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fxyd1Q9Z239 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fxyd1Q9Z239 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fxyd1Q9Z239 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fxyd1Q9Z239 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fxyd1Q9Z239 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fxyd1Q9Z239 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fxyd1Q9Z239 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fxyd1Q9Z239 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fxyd1Q9Z239 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fxyd1Q9Z239 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fxyd1Q9Z239 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fxyd1Q9Z239 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fxyd1Q9Z239 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fxyd1Q9Z239 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fxyd1Q9Z239 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fxyd1Q9Z239 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fxyd1Q9Z239 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fxyd1Q9Z239 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fxyd1Q9Z239 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fxyd1Q9Z239 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fxyd1Q9Z239 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fxyd1Q9Z239 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fxyd1Q9Z239 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fxyd1Q9Z239 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fxyd1Q9Z239 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fxyd1Q9Z239 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fxyd1Q9Z239 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fxyd1Q9Z239 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fxyd1Q9Z239 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fxyd1Q9Z239 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fxyd1Q9Z239 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fxyd1Q9Z239 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fxyd1Q9Z239 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fxyd1Q9Z239 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fxyd1Q9Z239 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fxyd1Q9Z239 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fxyd1Q9Z239 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fxyd1Q9Z239 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fxyd1Q9Z239 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fxyd1Q9Z239 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fxyd1Q9Z239 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fxyd1Q9Z239 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fxyd1Q9Z239 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fxyd1Q9Z239 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fxyd1Q9Z239 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fxyd1Q9Z239 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fxyd1Q9Z239 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fxyd1Q9Z239 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fxyd1Q9Z239 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fxyd1Q9Z239 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fxyd1Q9Z239 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fxyd1Q9Z239 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fxyd1Q9Z239 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fxyd1Q9Z239 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fxyd1Q9Z239 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fxyd1Q9Z239 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fxyd1Q9Z239 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fxyd1Q9Z239 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fxyd1Q9Z239 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fxyd1Q9Z239 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fxyd1Q9Z239 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fxyd1Q9Z239 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fxyd1Q9Z239 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fxyd1Q9Z239 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fxyd1Q9Z239 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fxyd1Q9Z239 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fxyd1Q9Z239 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fxyd1Q9Z239 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fxyd1Q9Z239 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fxyd1Q9Z239 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fxyd1Q9Z239 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fxyd1Q9Z239 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fxyd1Q9Z239 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fxyd1Q9Z239 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fxyd1Q9Z239 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fxyd1Q9Z239 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fxyd1Q9Z239 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fxyd1Q9Z239 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fxyd1Q9Z239 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fxyd1Q9Z239 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fxyd1Q9Z239 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms