Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z239

Fxyd1, Phospholemman, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fxyd1Q9Z239 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fxyd1Q9Z239 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Fxyd1Q9Z239 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Fxyd1Q9Z239 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Fxyd1Q9Z239 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Fxyd1Q9Z239 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Fxyd1Q9Z239 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Fxyd1Q9Z239 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Fxyd1Q9Z239 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Fxyd1Q9Z239 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Fxyd1Q9Z239 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Fxyd1Q9Z239 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Fxyd1Q9Z239 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Fxyd1Q9Z239 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Fxyd1Q9Z239 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Fxyd1Q9Z239 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Fxyd1Q9Z239 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Fxyd1Q9Z239 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Fxyd1Q9Z239 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Fxyd1Q9Z239 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Fxyd1Q9Z239 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Fxyd1Q9Z239 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Fxyd1Q9Z239 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Fxyd1Q9Z239 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Fxyd1Q9Z239 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Fxyd1Q9Z239 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Fxyd1Q9Z239 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Fxyd1Q9Z239 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Fxyd1Q9Z239 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Fxyd1Q9Z239 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Fxyd1Q9Z239 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Fxyd1Q9Z239 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Fxyd1Q9Z239 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Fxyd1Q9Z239 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Fxyd1Q9Z239 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Fxyd1Q9Z239 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Fxyd1Q9Z239 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Fxyd1Q9Z239 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Fxyd1Q9Z239 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Fxyd1Q9Z239 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Fxyd1Q9Z239 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Fxyd1Q9Z239 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Fxyd1Q9Z239 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
Fxyd1Q9Z239 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,72■■□□□ 1,39
Fxyd1Q9Z239 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Fxyd1Q9Z239 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Fxyd1Q9Z239 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Fxyd1Q9Z239 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Fxyd1Q9Z239 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Fxyd1Q9Z239 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Fxyd1Q9Z239 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Fxyd1Q9Z239 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
Fxyd1Q9Z239 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Fxyd1Q9Z239 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Fxyd1Q9Z239 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Fxyd1Q9Z239 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Fxyd1Q9Z239 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Fxyd1Q9Z239 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Fxyd1Q9Z239 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Fxyd1Q9Z239 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Fxyd1Q9Z239 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Fxyd1Q9Z239 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Fxyd1Q9Z239 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Fxyd1Q9Z239 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Fxyd1Q9Z239 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Fxyd1Q9Z239 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Fxyd1Q9Z239 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Fxyd1Q9Z239 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Fxyd1Q9Z239 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Fxyd1Q9Z239 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Fxyd1Q9Z239 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Fxyd1Q9Z239 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Fxyd1Q9Z239 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Fxyd1Q9Z239 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Fxyd1Q9Z239 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Fxyd1Q9Z239 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Fxyd1Q9Z239 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Fxyd1Q9Z239 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Fxyd1Q9Z239 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Fxyd1Q9Z239 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Fxyd1Q9Z239 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Fxyd1Q9Z239 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Fxyd1Q9Z239 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Fxyd1Q9Z239 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Fxyd1Q9Z239 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Fxyd1Q9Z239 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Fxyd1Q9Z239 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Fxyd1Q9Z239 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Fxyd1Q9Z239 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Fxyd1Q9Z239 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Fxyd1Q9Z239 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Fxyd1Q9Z239 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Fxyd1Q9Z239 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Fxyd1Q9Z239 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Fxyd1Q9Z239 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Fxyd1Q9Z239 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Fxyd1Q9Z239 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Fxyd1Q9Z239 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Fxyd1Q9Z239 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,44■■□□□ 1,18
Fxyd1Q9Z239 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms