Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Prok1Q14A28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prok1Q14A28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Prok1Q14A28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Prok1Q14A28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Prok1Q14A28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prok1Q14A28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prok1Q14A28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prok1Q14A28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prok1Q14A28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prok1Q14A28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prok1Q14A28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Prok1Q14A28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prok1Q14A28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prok1Q14A28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prok1Q14A28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prok1Q14A28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prok1Q14A28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prok1Q14A28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prok1Q14A28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prok1Q14A28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prok1Q14A28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prok1Q14A28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prok1Q14A28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prok1Q14A28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prok1Q14A28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prok1Q14A28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prok1Q14A28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prok1Q14A28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Prok1Q14A28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prok1Q14A28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prok1Q14A28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prok1Q14A28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prok1Q14A28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prok1Q14A28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prok1Q14A28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prok1Q14A28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prok1Q14A28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prok1Q14A28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prok1Q14A28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prok1Q14A28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prok1Q14A28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prok1Q14A28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prok1Q14A28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prok1Q14A28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prok1Q14A28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prok1Q14A28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prok1Q14A28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prok1Q14A28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prok1Q14A28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prok1Q14A28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prok1Q14A28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prok1Q14A28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prok1Q14A28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prok1Q14A28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prok1Q14A28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prok1Q14A28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prok1Q14A28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prok1Q14A28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prok1Q14A28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prok1Q14A28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prok1Q14A28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prok1Q14A28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prok1Q14A28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prok1Q14A28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prok1Q14A28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prok1Q14A28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prok1Q14A28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prok1Q14A28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prok1Q14A28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prok1Q14A28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prok1Q14A28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prok1Q14A28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prok1Q14A28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prok1Q14A28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prok1Q14A28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prok1Q14A28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prok1Q14A28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prok1Q14A28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prok1Q14A28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prok1Q14A28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prok1Q14A28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prok1Q14A28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prok1Q14A28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prok1Q14A28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prok1Q14A28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prok1Q14A28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prok1Q14A28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prok1Q14A28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prok1Q14A28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prok1Q14A28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prok1Q14A28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prok1Q14A28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prok1Q14A28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prok1Q14A28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prok1Q14A28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prok1Q14A28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prok1Q14A28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prok1Q14A28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prok1Q14A28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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