Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
P03980 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
P03980 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
P03980 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
P03980 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
P03980 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
P03980 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
P03980 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
P03980 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
P03980 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
P03980 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
P03980 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
P03980 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
P03980 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
P03980 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
P03980 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
P03980 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
P03980 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
P03980 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
P03980 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
P03980 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
P03980 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
P03980 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
P03980 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,28■■□□□ 1,32
P03980 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
P03980 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
P03980 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
P03980 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
P03980 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
P03980 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
P03980 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
P03980 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
P03980 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
P03980 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
P03980 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
P03980 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
P03980 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
P03980 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,71■■□□□ 1,23
P03980 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
P03980 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
P03980 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
P03980 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
P03980 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,57■■□□□ 1,2
P03980 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
P03980 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
P03980 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
P03980 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,45■■□□□ 1,18
P03980 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
P03980 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
P03980 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
P03980 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
P03980 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
P03980 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
P03980 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
P03980 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
P03980 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,17■■□□□ 1,14
P03980 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
P03980 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
P03980 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
P03980 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
P03980 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
P03980 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
P03980 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
P03980 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
P03980 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
P03980 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
P03980 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
P03980 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
P03980 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
P03980 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
P03980 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
P03980 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,84■■□□□ 1,09
P03980 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
P03980 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
P03980 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
P03980 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
P03980 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
P03980 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,66■■□□□ 1,06
P03980 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P03980 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
P03980 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
P03980 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
P03980 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
P03980 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
P03980 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
P03980 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,45■■□□□ 1,02
P03980 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
P03980 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
P03980 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
P03980 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
P03980 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
P03980 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
P03980 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
P03980 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
P03980 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
P03980 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
P03980 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
P03980 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
P03980 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
P03980 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
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