Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
P04945 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
P04945 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
P04945 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
P04945 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
P04945 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
P04945 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
P04945 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
P04945 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P04945 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
P04945 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
P04945 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
P04945 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
P04945 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
P04945 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
P04945 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
P04945 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P04945 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
P04945 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
P04945 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
P04945 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
P04945 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
P04945 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
P04945 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P04945 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P04945 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
P04945 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P04945 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
P04945 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P04945 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P04945 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P04945 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P04945 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
P04945 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
P04945 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P04945 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P04945 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P04945 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P04945 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P04945 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
P04945 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
P04945 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
P04945 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
P04945 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
P04945 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P04945 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
P04945 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P04945 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P04945 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P04945 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P04945 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P04945 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P04945 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P04945 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04945 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P04945 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
P04945 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04945 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P04945 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04945 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04945 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
P04945 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04945 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04945 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P04945 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04945 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P04945 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
P04945 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P04945 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04945 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P04945 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
P04945 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P04945 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P04945 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P04945 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P04945 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P04945 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P04945 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P04945 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P04945 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P04945 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P04945 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P04945 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P04945 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P04945 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P04945 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P04945 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P04945 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P04945 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P04945 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P04945 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P04945 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P04945 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P04945 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P04945 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P04945 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04945 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P04945 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04945 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
P04945 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms