Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Tm4sf20Q9CQY8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Tm4sf20Q9CQY8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tm4sf20Q9CQY8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Tm4sf20Q9CQY8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Tm4sf20Q9CQY8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Tm4sf20Q9CQY8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
Tm4sf20Q9CQY8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Tm4sf20Q9CQY8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,8■■□□□ 1,08
Tm4sf20Q9CQY8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Tm4sf20Q9CQY8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Tm4sf20Q9CQY8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Tm4sf20Q9CQY8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Tm4sf20Q9CQY8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Tm4sf20Q9CQY8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Tm4sf20Q9CQY8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Tm4sf20Q9CQY8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Tm4sf20Q9CQY8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Tm4sf20Q9CQY8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Tm4sf20Q9CQY8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Tm4sf20Q9CQY8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Tm4sf20Q9CQY8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,94■□□□□ 0,94
Tm4sf20Q9CQY8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,89■□□□□ 0,93
Tm4sf20Q9CQY8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Tm4sf20Q9CQY8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tm4sf20Q9CQY8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Tm4sf20Q9CQY8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Tm4sf20Q9CQY8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Tm4sf20Q9CQY8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Tm4sf20Q9CQY8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Tm4sf20Q9CQY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Tm4sf20Q9CQY8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Tm4sf20Q9CQY8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,58■□□□□ 0,89
Tm4sf20Q9CQY8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Tm4sf20Q9CQY8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Tm4sf20Q9CQY8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Tm4sf20Q9CQY8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tm4sf20Q9CQY8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Tm4sf20Q9CQY8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Tm4sf20Q9CQY8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tm4sf20Q9CQY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Tm4sf20Q9CQY8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Tm4sf20Q9CQY8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Tm4sf20Q9CQY8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Tm4sf20Q9CQY8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Tm4sf20Q9CQY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Tm4sf20Q9CQY8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Tm4sf20Q9CQY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Tm4sf20Q9CQY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Tm4sf20Q9CQY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Tm4sf20Q9CQY8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Tm4sf20Q9CQY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,09■□□□□ 0,81
Tm4sf20Q9CQY8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Tm4sf20Q9CQY8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Tm4sf20Q9CQY8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Tm4sf20Q9CQY8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,07■□□□□ 0,8
Tm4sf20Q9CQY8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Tm4sf20Q9CQY8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,06■□□□□ 0,8
Tm4sf20Q9CQY8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Tm4sf20Q9CQY8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Tm4sf20Q9CQY8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Tm4sf20Q9CQY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Tm4sf20Q9CQY8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Tm4sf20Q9CQY8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Tm4sf20Q9CQY8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Tm4sf20Q9CQY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Tm4sf20Q9CQY8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Tm4sf20Q9CQY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Tm4sf20Q9CQY8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Tm4sf20Q9CQY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Tm4sf20Q9CQY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Tm4sf20Q9CQY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,71■□□□□ 0,75
Tm4sf20Q9CQY8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,7■□□□□ 0,74
Tm4sf20Q9CQY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Tm4sf20Q9CQY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Tm4sf20Q9CQY8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Tm4sf20Q9CQY8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Tm4sf20Q9CQY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Tm4sf20Q9CQY8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,59■□□□□ 0,73
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