RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20481G3UXK4 153 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klk1b4P00757 256 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mzt1Q8BUR9 78 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DysfQ9ESD7 2090 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adamts20P59511 1906 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex26Q0VB26 296 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bles03Q8VD62 251 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EsdQ9R0P3 282 aa10.04□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wipf2Q6PEV3 440 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C730034F03RikQ8BGL5 111 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 S100a8P27005 89 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcl1b4P56844 120 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PmvkQ9D1G2 192 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-52A0A0A6YXC3 117 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6040Q4QY32 63 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcrg-V4A0A0B4J1J8 138 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm17455G3UW87 128 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SlpiP97430 131 aa10.03□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa10.02□□□□□ -0.8
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa26Q3L180 93 aa10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa24Q5G865 93 aa10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TirapQ99JY1 241 aa10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpx7Q99LJ6 186 aa10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl32Q9DCI9 187 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hivep3A2A884 2348 aa10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5129F6YHA9 99 aa10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa10.02□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wipf1Q8K1I7 493 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Synj2bpQ9D6K5 145 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MtorQ9JLN9 2549 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mapk1ip1Q9D7G9 263 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abca12E9Q876 2595 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9513B3GLJ6 99 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klf12O35738 402 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P06330 118 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm815Q3UWS2 115 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfand3Q497H0 227 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr3kQ9CQZ7 108 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dmrtc1c1Q9D410 238 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OtorQ9JIE3 128 aa10.01□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa10□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa10□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a48Q8BW66 306 aa10□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx22Q8C084 192 aa10□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp6v0bQ91V37 205 aa10□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bex1Q9R224 128 aa10□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930447F04RikA2AFR2 126 aa10□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9958Q8C9U4 106 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HilpdaQ9JLS0 64 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wisp2Q9Z0G4 251 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcrg-C3L7N479 172 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01738 130 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P04944 107 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav3-3Q5R1C3 114 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr498Q8VEW2 330 aa9.99□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il22ra2Q80XF5 230 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spag11Q8K4N2 71 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl20Q9CQL4 149 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bub3Q9WVA3 326 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav8-1A0A075B641 109 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Shisal2aA2A9G7 189 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AponG3X9D6 251 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr984Q8VFN1 314 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10638F6QEG2 257 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cited2O35740 269 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01739 132 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wfdc9Q3UW41 83 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a29Q8BL03 306 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cysrt1Q9D1E4 142 aa9.98□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01750 117 aa9.97□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav9-2A0A075B647 113 aa9.97□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa9.97□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Timm10bQ9WV96 100 aa9.97□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myo18bE9PV66 2605 aa9.97□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmo1Q5SXG7 201 aa9.97□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Them7Q9DCP4 223 aa9.97□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyyr1Q8VIH7 165 aa9.97□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnrc6aQ3UHK8 1896 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa9.96□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7257D3YX25 99 aa9.96□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01793 123 aa9.96□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr975Q8VG91 310 aa9.96□□□□□ -0.81
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv1-99F6XWB2 120 aa9.96□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plp1P60202 277 aa9.96□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex48Q9DA81 110 aa9.96□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klf13Q9JJZ6 289 aa9.96□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crip1P63254 77 aa9.96□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox6cQ9CPQ1 76 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.7 ms