RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SERP2Q8N6R1 65 aa5.05□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.05□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.04□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.04□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C20orf197Q8N268 126 aa5.02□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-216ENST00000607519 S4R3F8 94 aa5.02□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT2AP02795 61 aa5.01□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCA10Q71F78 164 aa5.01□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1FP04733 61 aa4.98□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE3BQ5TA77 95 aa4.98□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COX7CP15954 63 aa4.97□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.96□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP10-10P60014 251 aa4.94□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.94□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CSAG1Q6PB30 78 aa4.94□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.94□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A8MUN3 132 aa4.93□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DMAC1Q96GE9 116 aa4.93□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC179H3BU77 68 aa4.9□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.89□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDUFC1O43677 76 aa4.88□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ACYP2P14621 99 aa4.86□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 H7BZZ5 65 aa4.85□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.85□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.82□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.82□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 USH2AO75445 5202 aa4.81□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.8□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE4AQ5TA78 99 aa4.79□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.79□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.77□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COA5Q86WW8 74 aa4.76□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-216ENST00000607519 P0C880 135 aa4.74□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.73□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-216ENST00000607519 H0YAA0 97 aa4.73□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.7□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SSPOA2VEC9 5147 aa4.7□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.69□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.68□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CRIPTQ9P021 101 aa4.64□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1BP07438 61 aa4.63□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.63□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE1DQ5T752 114 aa4.63□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM258P61165 79 aa4.62□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 M0QZ58 72 aa4.6□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PCP4P48539 62 aa4.6□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q5VV11 94 aa4.58□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 R4GN34 69 aa4.58□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.55□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.55□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.55□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC01554Q52M75 96 aa4.55□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.51□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SEC61GP60059 68 aa4.5□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.5□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A1B0GU69 56 aa4.48□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.48□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A1B0GU33 70 aa4.47□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.46□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.46□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLAC4Q8WY50 150 aa4.45□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP10-5P60370 271 aa4.44□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.44□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A0D9SG42 100 aa4.43□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A6NN06 94 aa4.43□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1XP80297 61 aa4.4□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A8MU10 97 aa4.38□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRR15LQ9BU68 103 aa4.38□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PSPHP1O15172 72 aa4.34□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.34□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.33□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q1T7F1 81 aa4.33□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.32□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP12-1P59990 96 aa4.31□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP12-2P59991 146 aa4.31□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.3□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.28□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 V9GYY9 64 aa4.28□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.26□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UQCR11O14957 56 aa4.25□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.24□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KMT2DO14686 5537 aa4.23□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.22□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A6NED7 52 aa4.16□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP10-12P60413 245 aa4.15□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.15□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.14□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.08□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NEBP20929 6669 aa4.05□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-9P26371 169 aa4.05□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SVIPQ8NHG7 77 aa4.04□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.03□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 176.8 ms