RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 A0A0U1RQV1 116 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-220ENST00000550700 COX7CP15954 63 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-220ENST00000550700 MUC17Q685J3 4493 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-220ENST00000550700 NDUFC1O43677 76 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-220ENST00000550700 KLKP1Q107X0 134 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-220ENST00000550700 HRES1P13985 223 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-220ENST00000550700 C20orf197Q8N268 126 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 FAM236CP0DP71 79 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 A8MUN3 132 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 SNURFQ9Y675 71 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 C4orf26Q17RF5 130 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-220ENST00000550700 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-220ENST00000550700 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-220ENST00000550700 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-220ENST00000550700 RNF213Q63HN8 5207 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-220ENST00000550700 CCDC179H3BU77 68 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-220ENST00000550700 DMAC1Q96GE9 116 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-220ENST00000550700 H7BZZ5 65 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-220ENST00000550700 ACYP2P14621 99 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-220ENST00000550700 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CS-220ENST00000550700 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-220ENST00000550700 MUC2Q02817 5179 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-220ENST00000550700 TMEM258P61165 79 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-220ENST00000550700 S4R3F8 94 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-220ENST00000550700 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-220ENST00000550700 M0R2T5 61 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-220ENST00000550700 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-220ENST00000550700 SEC61GP60059 68 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-220ENST00000550700 CSAG1Q6PB30 78 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-220ENST00000550700 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-220ENST00000550700 MT1HP80294 61 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-220ENST00000550700 LCA10Q71F78 164 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-220ENST00000550700 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.52□□□□□ -1.69
CS-220ENST00000550700 COA5Q86WW8 74 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-220ENST00000550700 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CS-220ENST00000550700 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-220ENST00000550700 V9GYY9 64 aa4.47□□□□□ -1.69
CS-220ENST00000550700 H0YAA0 97 aa4.46□□□□□ -1.7
CS-220ENST00000550700 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.46□□□□□ -1.7
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CS-220ENST00000550700 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
CS-220ENST00000550700 CRIPTQ9P021 101 aa4.38□□□□□ -1.71
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-10P60014 251 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-220ENST00000550700 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-220ENST00000550700 PRR15LQ9BU68 103 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-220ENST00000550700 PRO0628Q9UI54 55 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-220ENST00000550700 MT2AP02795 61 aa4.34□□□□□ -1.71
CS-220ENST00000550700 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.32□□□□□ -1.72
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GU69 56 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-220ENST00000550700 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-220ENST00000550700 MT1FP04733 61 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-220ENST00000550700 Q1T7F1 81 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-220ENST00000550700 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-220ENST00000550700 M0QZ58 72 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-220ENST00000550700 R4GN34 69 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-220ENST00000550700 P0C880 135 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GU33 70 aa4.23□□□□□ -1.73
CS-220ENST00000550700 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-220ENST00000550700 Q5VV11 94 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-220ENST00000550700 UQCR11O14957 56 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-220ENST00000550700 PSPHP1O15172 72 aa4.14□□□□□ -1.75
CS-220ENST00000550700 A6NN06 94 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-220ENST00000550700 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-220ENST00000550700 PMAIP1Q13794 54 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-220ENST00000550700 LINC01554Q52M75 96 aa4.1□□□□□ -1.75
CS-220ENST00000550700 PLAC4Q8WY50 150 aa4.1□□□□□ -1.75
CS-220ENST00000550700 A6NED7 52 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-220ENST00000550700 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-220ENST00000550700 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-220ENST00000550700 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-220ENST00000550700 A0A0D9SG42 100 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-220ENST00000550700 K7ERS5 55 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-220ENST00000550700 MT1BP07438 61 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4□□□□□ -1.77
CS-220ENST00000550700 PRO2289Q9P1D8 64 aa4□□□□□ -1.77
CS-220ENST00000550700 A0A0A0MQY5 61 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-220ENST00000550700 A8MU10 97 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-220ENST00000550700 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-220ENST00000550700 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-220ENST00000550700 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-220ENST00000550700 KRTAP12-1P59990 96 aa3.97□□□□□ -1.77
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CS-220ENST00000550700 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-220ENST00000550700 BRK1Q8WUW1 75 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-220ENST00000550700 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-220ENST00000550700 KRTAP12-2P59991 146 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-220ENST00000550700 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-5P60370 271 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-220ENST00000550700 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.9□□□□□ -1.79
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-9P26371 169 aa3.89□□□□□ -1.79
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
CS-220ENST00000550700 MT1XP80297 61 aa3.86□□□□□ -1.79
CS-220ENST00000550700 SSPOA2VEC9 5147 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.78□□□□□ -1.8
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