RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.9	□□□□□ -1.46
DDB1-223	ENST00000543658	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		5.89	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658		S4R3F8	94 aa		5.88	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.88	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658	MT1H	P80294	61 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658		H7BZZ5	65 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658	ACYP2	P14621	99 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DDB1-223	ENST00000543658	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DDB1-223	ENST00000543658	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DDB1-223	ENST00000543658	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DDB1-223	ENST00000543658	LCA10	Q71F78	164 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DDB1-223	ENST00000543658	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DDB1-223	ENST00000543658	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DDB1-223	ENST00000543658	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DDB1-223	ENST00000543658	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DDB1-223	ENST00000543658	COA5	Q86WW8	74 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DDB1-223	ENST00000543658		V9GYY9	64 aa		5.6	□□□□□ -1.51
DDB1-223	ENST00000543658		H0YAA0	97 aa		5.58	□□□□□ -1.52
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP10-10	P60014	251 aa		5.58	□□□□□ -1.52
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5.58	□□□□□ -1.52
DDB1-223	ENST00000543658	MT2A	P02795	61 aa		5.57	□□□□□ -1.52
DDB1-223	ENST00000543658	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.56	□□□□□ -1.52
DDB1-223	ENST00000543658		Q1T7F1	81 aa		5.54	□□□□□ -1.52
DDB1-223	ENST00000543658	MT1F	P04733	61 aa		5.53	□□□□□ -1.52
DDB1-223	ENST00000543658	SEC61G	P60059	68 aa		5.53	□□□□□ -1.52
DDB1-223	ENST00000543658	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DDB1-223	ENST00000543658	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DDB1-223	ENST00000543658	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DDB1-223	ENST00000543658	CRIPT	Q9P021	101 aa		5.46	□□□□□ -1.54
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GU69	56 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DDB1-223	ENST00000543658		P0C880	135 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DDB1-223	ENST00000543658	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DDB1-223	ENST00000543658		R4GN34	69 aa		5.42	□□□□□ -1.54
DDB1-223	ENST00000543658	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DDB1-223	ENST00000543658		M0QZ58	72 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DDB1-223	ENST00000543658	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GU33	70 aa		5.33	□□□□□ -1.56
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.33	□□□□□ -1.56
DDB1-223	ENST00000543658	PSPHP1	O15172	72 aa		5.31	□□□□□ -1.56
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
DDB1-223	ENST00000543658	LINC01554	Q52M75	96 aa		5.3	□□□□□ -1.56
DDB1-223	ENST00000543658		Q5VV11	94 aa		5.3	□□□□□ -1.56
DDB1-223	ENST00000543658	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DDB1-223	ENST00000543658		A6NED7	52 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DDB1-223	ENST00000543658	UQCR11	O14957	56 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DDB1-223	ENST00000543658	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DDB1-223	ENST00000543658	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DDB1-223	ENST00000543658	PLAC4	Q8WY50	150 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0D9SG42	100 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DDB1-223	ENST00000543658	MT1B	P07438	61 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DDB1-223	ENST00000543658	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DDB1-223	ENST00000543658		A6NN06	94 aa		5.15	□□□□□ -1.59
DDB1-223	ENST00000543658	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DDB1-223	ENST00000543658	USH2A	O75445	5202 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DDB1-223	ENST00000543658	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DDB1-223	ENST00000543658	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DDB1-223	ENST00000543658		A8MU10	97 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DDB1-223	ENST00000543658	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DDB1-223	ENST00000543658	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DDB1-223	ENST00000543658	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DDB1-223	ENST00000543658		K7ERS5	55 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DDB1-223	ENST00000543658	SSPO	A2VEC9	5147 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP12-2	P59991	146 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DDB1-223	ENST00000543658	MT1X	P80297	61 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDB1-223	ENST00000543658	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDB1-223	ENST00000543658	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-223	ENST00000543658	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DDB1-223	ENST00000543658	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DDB1-223	ENST00000543658	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DDB1-223	ENST00000543658	TNP1	P09430	55 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DDB1-223	ENST00000543658	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DDB1-223	ENST00000543658	ROMO1	P60602	79 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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