RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 C4orf26Q17RF5 130 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 MP68P56378 58 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 OCR1Q9BZK8 76 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.66□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00208Q96KT6 92 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-204ENST00000503638 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-204ENST00000503638 C5orf47Q569G3 176 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-204ENST00000503638 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BPC8 53 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-204ENST00000503638 KLKP1Q107X0 134 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-204ENST00000503638 S4R3F8 94 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-204ENST00000503638 SERP2Q8N6R1 65 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 LCA10Q71F78 164 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 SNURFQ9Y675 71 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 SSPOA2VEC9 5147 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 A8MUN3 132 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 C20orf197Q8N268 126 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 CSAG1Q6PB30 78 aa6.4□□□□□ -1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.4□□□□□ -1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 USH2AO75445 5202 aa6.4□□□□□ -1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 MT2AP02795 61 aa6.39□□□□□ -1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP10-10P60014 251 aa6.39□□□□□ -1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFC1O43677 76 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 MT1FP04733 61 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 DMAC1Q96GE9 116 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 COX7CP15954 63 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-204ENST00000503638 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-204ENST00000503638 ACYP2P14621 99 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-204ENST00000503638 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-204ENST00000503638 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-204ENST00000503638 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-204ENST00000503638 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC179H3BU77 68 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-204ENST00000503638 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-204ENST00000503638 H7BZZ5 65 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-204ENST00000503638 H0YAA0 97 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-204ENST00000503638 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-204ENST00000503638 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PGGT1B-204ENST00000503638 COA5Q86WW8 74 aa6.1□□□□□ -1.43
PGGT1B-204ENST00000503638 CRIPTQ9P021 101 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-204ENST00000503638 P0C880 135 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 R4GN34 69 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 M0QZ58 72 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 Q5VV11 94 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SEC61GP60059 68 aa5.94□□□□□ -1.46
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM258P61165 79 aa5.94□□□□□ -1.46
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.93□□□□□ -1.46
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01554Q52M75 96 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-204ENST00000503638 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-204ENST00000503638 MT1BP07438 61 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GU69 56 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 PLAC4Q8WY50 150 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 PCP4P48539 62 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 A6NN06 94 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 NEBP20929 6669 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GU33 70 aa5.75□□□□□ -1.49
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR15LQ9BU68 103 aa5.75□□□□□ -1.49
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0D9SG42 100 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP10-5P60370 271 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-204ENST00000503638 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-204ENST00000503638 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-204ENST00000503638 MT1XP80297 61 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-204ENST00000503638 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-204ENST00000503638 V9GYY9 64 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-204ENST00000503638 A8MU10 97 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-204ENST00000503638 PSPHP1O15172 72 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-204ENST00000503638 UQCR11O14957 56 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP5-9P26371 169 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 KMT2DO14686 5537 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 Q1T7F1 81 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 MDN1Q9NU22 5596 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP12-1P59990 96 aa5.48□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP12-2P59991 146 aa5.47□□□□□ -1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.44□□□□□ -1.54
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.41□□□□□ -1.54
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.41□□□□□ -1.54
PGGT1B-204ENST00000503638 A6NED7 52 aa5.39□□□□□ -1.55
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