RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 A8MUN3 132 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-211ENST00000486829 M0R2T5 61 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-211ENST00000486829 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-211ENST00000486829 SEC61GP60059 68 aa5.64□□□□□ -1.51
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.63□□□□□ -1.51
ARHGEF3-211ENST00000486829 SNURFQ9Y675 71 aa5.63□□□□□ -1.51
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.6□□□□□ -1.51
ARHGEF3-211ENST00000486829 NDUFC1O43677 76 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-211ENST00000486829 S4R3F8 94 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.57□□□□□ -1.52
ARHGEF3-211ENST00000486829 DMAC1Q96GE9 116 aa5.57□□□□□ -1.52
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCA10Q71F78 164 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACYP2P14621 99 aa5.51□□□□□ -1.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 CSAG1Q6PB30 78 aa5.51□□□□□ -1.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCDC179H3BU77 68 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 H7BZZ5 65 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.48□□□□□ -1.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.46□□□□□ -1.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.46□□□□□ -1.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.42□□□□□ -1.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.42□□□□□ -1.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.41□□□□□ -1.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 MT2AP02795 61 aa5.4□□□□□ -1.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM258P61165 79 aa5.37□□□□□ -1.55
ARHGEF3-211ENST00000486829 H0YAA0 97 aa5.36□□□□□ -1.55
ARHGEF3-211ENST00000486829 COA5Q86WW8 74 aa5.36□□□□□ -1.55
ARHGEF3-211ENST00000486829 MT1FP04733 61 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-10P60014 251 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.29□□□□□ -1.56
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.28□□□□□ -1.56
ARHGEF3-211ENST00000486829 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.27□□□□□ -1.57
ARHGEF3-211ENST00000486829 CRIPTQ9P021 101 aa5.27□□□□□ -1.57
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.25□□□□□ -1.57
ARHGEF3-211ENST00000486829 USH2AO75445 5202 aa5.23□□□□□ -1.57
ARHGEF3-211ENST00000486829 SSPOA2VEC9 5147 aa5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3-211ENST00000486829 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3-211ENST00000486829 P0C880 135 aa5.17□□□□□ -1.58
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.17□□□□□ -1.58
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 R4GN34 69 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRAC1Q96KF2 57 aa5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 M0QZ58 72 aa5.1□□□□□ -1.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 V9GYY9 64 aa5.1□□□□□ -1.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1B0GU69 56 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRR15LQ9BU68 103 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q5VV11 94 aa5.06□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.06□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.03□□□□□ -1.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1B0GU33 70 aa5.02□□□□□ -1.61
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMIM26A0A096LP01 95 aa5□□□□□ -1.61
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCE3BQ5TA77 95 aa5□□□□□ -1.61
ARHGEF3-211ENST00000486829 MT1BP07438 61 aa4.99□□□□□ -1.61
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC01554Q52M75 96 aa4.99□□□□□ -1.61
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q1T7F1 81 aa4.98□□□□□ -1.61
ARHGEF3-211ENST00000486829 A6NN06 94 aa4.96□□□□□ -1.62
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.96□□□□□ -1.62
ARHGEF3-211ENST00000486829 PLAC4Q8WY50 150 aa4.96□□□□□ -1.62
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.92□□□□□ -1.62
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.91□□□□□ -1.62
ARHGEF3-211ENST00000486829 UQCR11O14957 56 aa4.9□□□□□ -1.63
ARHGEF3-211ENST00000486829 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
ARHGEF3-211ENST00000486829 PSPHP1O15172 72 aa4.88□□□□□ -1.63
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.87□□□□□ -1.63
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.87□□□□□ -1.63
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0D9SG42 100 aa4.86□□□□□ -1.63
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.83□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-5P60370 271 aa4.83□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 A8MU10 97 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.79□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP12-1P59990 96 aa4.78□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 MT1XP80297 61 aa4.78□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.78□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.78□□□□□ -1.64
ARHGEF3-211ENST00000486829 A6NED7 52 aa4.76□□□□□ -1.65
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP12-2P59991 146 aa4.74□□□□□ -1.65
ARHGEF3-211ENST00000486829 K7ERS5 55 aa4.69□□□□□ -1.66
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCE1DQ5T752 114 aa4.68□□□□□ -1.66
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.66□□□□□ -1.66
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.64□□□□□ -1.67
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRO0628Q9UI54 55 aa4.59□□□□□ -1.67
ARHGEF3-211ENST00000486829 NDUFAF8A1L188 74 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP5-9P26371 169 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-12P60413 245 aa4.56□□□□□ -1.68
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.55□□□□□ -1.68
ARHGEF3-211ENST00000486829 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.53□□□□□ -1.68
ARHGEF3-211ENST00000486829 KMT2DO14686 5537 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-211ENST00000486829 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-211ENST00000486829 TNP1P09430 55 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.7 ms