RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1B0GVX0 72 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFS5O43920 106 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 PRR15LQ9BU68 103 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 PCOTHQ58A44 107 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 C9orf92A6NGG3 77 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 LCA10Q71F78 164 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 A6NED7 52 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 A6NN06 94 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 C8orf87E5RJ46 101 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 M0R2T5 61 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 HRES1P13985 223 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-207ENST00000484547 ACYP2P14621 99 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-207ENST00000484547 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-207ENST00000484547 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-207ENST00000484547 DMAC1Q96GE9 116 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-207ENST00000484547 A8MU10 97 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-207ENST00000484547 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-207ENST00000484547 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SPINK7P58062 85 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 Q5W150 140 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SSPOA2VEC9 5147 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV2-30P06310 120 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 USH2AO75445 5202 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00313P59037 77 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1B0GU69 56 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-207ENST00000484547 UQCR11O14957 56 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-207ENST00000484547 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-207ENST00000484547 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-207ENST00000484547 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-207ENST00000484547 MT2AP02795 61 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-207ENST00000484547 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC01554Q52M75 96 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-207ENST00000484547 MT1FP04733 61 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-207ENST00000484547 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-207ENST00000484547 A8MUU9 505 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP10-10P60014 251 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-207ENST00000484547 PRAC1Q96KF2 57 aa5.84□□□□□ -1.47
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RABGEF1-207ENST00000484547 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1-207ENST00000484547 CSAG1Q6PB30 78 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-207ENST00000484547 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-207ENST00000484547 K7ERS5 55 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-207ENST00000484547 NEBP20929 6669 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BS24 57 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-207ENST00000484547 ROMO1P60602 79 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-207ENST00000484547 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-207ENST00000484547 LCE1DQ5T752 114 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-207ENST00000484547 S4R3F8 94 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-207ENST00000484547 LCE4AQ5TA78 99 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.37□□□□□ -1.55
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RABGEF1-207ENST00000484547 KMT2DO14686 5537 aa5.34□□□□□ -1.55
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RABGEF1-207ENST00000484547 M0QZ58 72 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP5-9P26371 169 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1-207ENST00000484547 P0C880 135 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP10-5P60370 271 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP12-1P59990 96 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A0D9SG42 100 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP12-2P59991 146 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.13□□□□□ -1.59
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