RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.4	□□□□□ -1.54
POLR1A-204	ENST00000424089	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.37	□□□□□ -1.55
POLR1A-204	ENST00000424089	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5.36	□□□□□ -1.55
POLR1A-204	ENST00000424089	PSPHP1	O15172	72 aa		5.35	□□□□□ -1.55
POLR1A-204	ENST00000424089	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.35	□□□□□ -1.55
POLR1A-204	ENST00000424089	SPINK7	P58062	85 aa		5.34	□□□□□ -1.55
POLR1A-204	ENST00000424089		Q5VV11	94 aa		5.34	□□□□□ -1.55
POLR1A-204	ENST00000424089	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.34	□□□□□ -1.55
POLR1A-204	ENST00000424089	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
POLR1A-204	ENST00000424089	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.32	□□□□□ -1.56
POLR1A-204	ENST00000424089	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		5.32	□□□□□ -1.56
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.32	□□□□□ -1.56
POLR1A-204	ENST00000424089	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.3	□□□□□ -1.56
POLR1A-204	ENST00000424089	XP32	Q5T750	250 aa		5.29	□□□□□ -1.56
POLR1A-204	ENST00000424089	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.28	□□□□□ -1.56
POLR1A-204	ENST00000424089	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		5.27	□□□□□ -1.57
POLR1A-204	ENST00000424089		A0A1B0GU69	56 aa		5.24	□□□□□ -1.57
POLR1A-204	ENST00000424089		A6NED7	52 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POLR1A-204	ENST00000424089	MUC17	Q685J3	4493 aa		5.22	□□□□□ -1.57
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.22	□□□□□ -1.57
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POLR1A-204	ENST00000424089	SEC61G	P60059	68 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POLR1A-204	ENST00000424089	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POLR1A-204	ENST00000424089	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
POLR1A-204	ENST00000424089	LCA10	Q71F78	164 aa		5.15	□□□□□ -1.59
POLR1A-204	ENST00000424089	UQCR11	O14957	56 aa		5.14	□□□□□ -1.59
POLR1A-204	ENST00000424089	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.12	□□□□□ -1.59
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
POLR1A-204	ENST00000424089	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		5.09	□□□□□ -1.59
POLR1A-204	ENST00000424089	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
POLR1A-204	ENST00000424089	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.08	□□□□□ -1.6
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		5.08	□□□□□ -1.6
POLR1A-204	ENST00000424089		S4R3F8	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
POLR1A-204	ENST00000424089		A8MU10	97 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLR1A-204	ENST00000424089	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLR1A-204	ENST00000424089	LCE2C	Q5TA81	110 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLR1A-204	ENST00000424089		A0A1B0GU33	70 aa		5.03	□□□□□ -1.6
POLR1A-204	ENST00000424089	MT1H	P80294	61 aa		5.01	□□□□□ -1.61
POLR1A-204	ENST00000424089		A6NN06	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLR1A-204	ENST00000424089		M0R2T5	61 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLR1A-204	ENST00000424089	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1A-204	ENST00000424089		H0YAA0	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1A-204	ENST00000424089	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1A-204	ENST00000424089		K7ERS5	55 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1A-204	ENST00000424089	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1A-204	ENST00000424089		M0QZ58	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POLR1A-204	ENST00000424089		P0C880	135 aa		4.82	□□□□□ -1.64
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.81	□□□□□ -1.64
POLR1A-204	ENST00000424089	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
POLR1A-204	ENST00000424089	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
POLR1A-204	ENST00000424089	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
POLR1A-204	ENST00000424089	USH2A	O75445	5202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POLR1A-204	ENST00000424089		A0A0D9SG42	100 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POLR1A-204	ENST00000424089	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POLR1A-204	ENST00000424089		R4GN34	69 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POLR1A-204	ENST00000424089	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POLR1A-204	ENST00000424089	ROMO1	P60602	79 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POLR1A-204	ENST00000424089	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLR1A-204	ENST00000424089	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1A-204	ENST00000424089	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1A-204	ENST00000424089	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLR1A-204	ENST00000424089	MT2A	P02795	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1A-204	ENST00000424089	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1A-204	ENST00000424089	MT1F	P04733	61 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.5	□□□□□ -1.69
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.49	□□□□□ -1.69
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.47	□□□□□ -1.69
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.47	□□□□□ -1.69
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.46	□□□□□ -1.7
POLR1A-204	ENST00000424089	NEB	P20929	6669 aa		4.46	□□□□□ -1.7
POLR1A-204	ENST00000424089	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.43	□□□□□ -1.7
POLR1A-204	ENST00000424089	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.42	□□□□□ -1.7
POLR1A-204	ENST00000424089	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.38	□□□□□ -1.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.36	□□□□□ -1.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.34	□□□□□ -1.71
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.32	□□□□□ -1.72
POLR1A-204	ENST00000424089	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.31	□□□□□ -1.72
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.28	□□□□□ -1.72
POLR1A-204	ENST00000424089	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.28	□□□□□ -1.72
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.27	□□□□□ -1.73
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.27	□□□□□ -1.73
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.27	□□□□□ -1.73
POLR1A-204	ENST00000424089	TNP1	P09430	55 aa		4.26	□□□□□ -1.73
POLR1A-204	ENST00000424089	KMT2D	O14686	5537 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POLR1A-204	ENST00000424089	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POLR1A-204	ENST00000424089	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POLR1A-204	ENST00000424089	MT1B	P07438	61 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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