RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174387.1

Usp3-211, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Usp3, Length 1,901 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3-211ENSMUST00000174387 Dazap1Q9JII5 406 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa9.53□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ighv1-58A0A075B5W9 117 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Shisal2aA2A9G7 189 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gm17727E9Q4V7 109 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Scgb2a2J3KMP9 96 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Siah2Q06986 325 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Olfr1419Q7TQS2 343 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Sox21Q811W0 276 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Zmat4Q8BZ94 229 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Rasl11bQ922H7 247 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Chchd5Q9CQP3 110 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 AhspQ9CY02 102 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Cbln1Q9R171 193 aa9.52□□□□□ -0.88
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Trav16A0A075B653 116 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Plcxd2B2RXA1 340 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gm6904E9PVF1 202 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Klf12O35738 402 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 PigyP0C1P0 71 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gpm6bP35803 328 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ccl21aP84444 133 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ccl21bP86792 133 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ccl21cP86793 133 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Prok1Q14A28 105 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Olfr1209Q3SXJ3 310 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Psg25Q497W1 475 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Tmem256Q5F285 113 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Dppa1Q810Y7 116 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Saxo2Q8BQB6 394 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Tmem91Q8C581 172 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Mrpl33Q9CQP0 65 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Fam162bQ9CX19 157 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Pdzd11Q9CZG9 140 aa9.52□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Trav14n-3A0A075B645 120 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Olfr1293-psA0A1L1SVB5 326 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 9130204L05RikG3UWB8 92 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 P04219 140 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Sox15P43267 231 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Spink11Q09TK7 88 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 MymxQ2Q5T5 84 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gm16686Q3UMN9 131 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Obox7Q4KL20 218 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Slc17a2Q5SZA1 478 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Olfr904Q7TRC9 310 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Samd10Q7TST3 202 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ifi27Q8C6G0 260 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 D630044L22RikQ8C701 164 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Tbx19Q99ME7 446 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Chchd1Q9CQA6 118 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Lelp1Q9DAE3 120 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Znf580Q9DB38 172 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Them7Q9DCP4 223 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Tomm40Q9QYA2 361 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Zfp53Q9Z117 652 aa9.51□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 TcapO70548 167 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 P01643 108 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 P01820 115 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Rhox4eQ504P9 205 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Trav2Q5R1I9 109 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Klhdc1Q80YG3 406 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Obox8V9GWY9 217 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Olfr1320A2AHM8 319 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Socs3O35718 225 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ins2P01326 110 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 F2rl1P55086 399 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 SNORCQ9CXL7 121 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Tnfrsf13cQ9D8D0 175 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Bub3Q9WVA3 326 aa9.5□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Sdk1Q3UH53 2193 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Igkv1-133A0A0B4J1H8 120 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gm21983D6RFS9 131 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gm5878E9PUB3 99 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gm15056F6ZR08 88 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 1700067P10RikG3X8U2 183 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Sprr3O09116 238 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gnb4P29387 340 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 A930003A15RikQ3U552 87 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Prelid1Q8R107 217 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 ChtopQ9CY57 249 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Plekhb2Q9QZC7 221 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Trav9d-1A0A075B699 112 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Trav6d-7A0A075B6B0 112 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Foxi3E0CZH3 425 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Olfr235E9Q9Z6 312 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Itgb1bp1O35671 200 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Gosr1O88630 250 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 AsipQ03288 131 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 AW146154Q3TPQ7 468 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 H2al1nQ497L1 109 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Usmg5Q78IK2 58 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Olfr1381Q7TQT4 311 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Mapk1ip1Q9D7G9 263 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Med12A2AGH6 2190 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp3-211ENSMUST00000174387 Tcrg-V6A0A075B5Y8 134 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.7 ms