Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox15P43267 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox15P43267 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox15P43267 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox15P43267 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox15P43267 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox15P43267 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox15P43267 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox15P43267 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox15P43267 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox15P43267 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox15P43267 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox15P43267 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox15P43267 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox15P43267 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox15P43267 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox15P43267 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox15P43267 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox15P43267 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox15P43267 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox15P43267 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox15P43267 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox15P43267 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox15P43267 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox15P43267 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox15P43267 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox15P43267 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox15P43267 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox15P43267 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox15P43267 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox15P43267 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox15P43267 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox15P43267 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox15P43267 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox15P43267 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox15P43267 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox15P43267 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox15P43267 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox15P43267 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox15P43267 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox15P43267 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox15P43267 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox15P43267 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox15P43267 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox15P43267 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox15P43267 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox15P43267 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox15P43267 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox15P43267 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox15P43267 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox15P43267 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox15P43267 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox15P43267 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox15P43267 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox15P43267 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox15P43267 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox15P43267 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox15P43267 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox15P43267 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox15P43267 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox15P43267 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox15P43267 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox15P43267 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox15P43267 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox15P43267 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox15P43267 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox15P43267 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox15P43267 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox15P43267 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox15P43267 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox15P43267 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox15P43267 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox15P43267 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox15P43267 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox15P43267 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox15P43267 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox15P43267 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox15P43267 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox15P43267 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox15P43267 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox15P43267 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox15P43267 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox15P43267 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox15P43267 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox15P43267 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox15P43267 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox15P43267 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox15P43267 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox15P43267 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox15P43267 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox15P43267 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox15P43267 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox15P43267 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox15P43267 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox15P43267 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox15P43267 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox15P43267 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox15P43267 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox15P43267 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox15P43267 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms