Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL20

Obox7, MCG6337, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox7Q4KL20 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Obox7Q4KL20 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Obox7Q4KL20 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Obox7Q4KL20 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Obox7Q4KL20 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Obox7Q4KL20 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Obox7Q4KL20 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Obox7Q4KL20 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Obox7Q4KL20 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Obox7Q4KL20 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Obox7Q4KL20 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Obox7Q4KL20 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Obox7Q4KL20 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Obox7Q4KL20 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
Obox7Q4KL20 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Obox7Q4KL20 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
Obox7Q4KL20 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Obox7Q4KL20 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Obox7Q4KL20 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Obox7Q4KL20 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Obox7Q4KL20 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Obox7Q4KL20 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Obox7Q4KL20 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Obox7Q4KL20 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Obox7Q4KL20 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Obox7Q4KL20 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,39■■□□□ 1,33
Obox7Q4KL20 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Obox7Q4KL20 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Obox7Q4KL20 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
Obox7Q4KL20 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Obox7Q4KL20 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Obox7Q4KL20 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Obox7Q4KL20 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Obox7Q4KL20 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Obox7Q4KL20 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Obox7Q4KL20 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,27
Obox7Q4KL20 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Obox7Q4KL20 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Obox7Q4KL20 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,83■■□□□ 1,25
Obox7Q4KL20 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Obox7Q4KL20 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Obox7Q4KL20 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Obox7Q4KL20 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Obox7Q4KL20 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Obox7Q4KL20 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Obox7Q4KL20 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Obox7Q4KL20 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,54■■□□□ 1,2
Obox7Q4KL20 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Obox7Q4KL20 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Obox7Q4KL20 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
Obox7Q4KL20 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Obox7Q4KL20 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Obox7Q4KL20 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Obox7Q4KL20 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Obox7Q4KL20 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Obox7Q4KL20 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Obox7Q4KL20 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Obox7Q4KL20 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,06■■□□□ 1,12
Obox7Q4KL20 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Obox7Q4KL20 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Obox7Q4KL20 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Obox7Q4KL20 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Obox7Q4KL20 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Obox7Q4KL20 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Obox7Q4KL20 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Obox7Q4KL20 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Obox7Q4KL20 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Obox7Q4KL20 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Obox7Q4KL20 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,89■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Obox7Q4KL20 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Obox7Q4KL20 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Obox7Q4KL20 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Obox7Q4KL20 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Obox7Q4KL20 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Obox7Q4KL20 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Obox7Q4KL20 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Obox7Q4KL20 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Obox7Q4KL20 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Obox7Q4KL20 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Obox7Q4KL20 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Obox7Q4KL20 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Obox7Q4KL20 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Obox7Q4KL20 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Obox7Q4KL20 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Obox7Q4KL20 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Obox7Q4KL20 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Obox7Q4KL20 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Obox7Q4KL20 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Obox7Q4KL20 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Obox7Q4KL20 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms