Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL20

Obox7, MCG6337, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox7Q4KL20 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Obox7Q4KL20 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Obox7Q4KL20 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Obox7Q4KL20 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Obox7Q4KL20 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Obox7Q4KL20 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Obox7Q4KL20 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Obox7Q4KL20 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Obox7Q4KL20 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Obox7Q4KL20 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Obox7Q4KL20 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Obox7Q4KL20 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Obox7Q4KL20 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Obox7Q4KL20 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Obox7Q4KL20 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Obox7Q4KL20 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Obox7Q4KL20 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Obox7Q4KL20 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Obox7Q4KL20 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Obox7Q4KL20 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Obox7Q4KL20 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Obox7Q4KL20 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Obox7Q4KL20 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Obox7Q4KL20 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Obox7Q4KL20 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Obox7Q4KL20 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Obox7Q4KL20 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Obox7Q4KL20 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Obox7Q4KL20 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Obox7Q4KL20 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Obox7Q4KL20 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Obox7Q4KL20 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Obox7Q4KL20 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Obox7Q4KL20 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Obox7Q4KL20 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Obox7Q4KL20 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Obox7Q4KL20 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Obox7Q4KL20 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Obox7Q4KL20 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Obox7Q4KL20 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Obox7Q4KL20 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Obox7Q4KL20 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Obox7Q4KL20 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Obox7Q4KL20 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Obox7Q4KL20 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Obox7Q4KL20 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Obox7Q4KL20 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Obox7Q4KL20 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Obox7Q4KL20 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Obox7Q4KL20 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Obox7Q4KL20 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Obox7Q4KL20 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Obox7Q4KL20 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Obox7Q4KL20 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Obox7Q4KL20 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obox7Q4KL20 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Obox7Q4KL20 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Obox7Q4KL20 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Obox7Q4KL20 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Obox7Q4KL20 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Obox7Q4KL20 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Obox7Q4KL20 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Obox7Q4KL20 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Obox7Q4KL20 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Obox7Q4KL20 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Obox7Q4KL20 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Obox7Q4KL20 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox7Q4KL20 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox7Q4KL20 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Obox7Q4KL20 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Obox7Q4KL20 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Obox7Q4KL20 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Obox7Q4KL20 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Obox7Q4KL20 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Obox7Q4KL20 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Obox7Q4KL20 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Obox7Q4KL20 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Obox7Q4KL20 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Obox7Q4KL20 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Obox7Q4KL20 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Obox7Q4KL20 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Obox7Q4KL20 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Obox7Q4KL20 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Obox7Q4KL20 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox7Q4KL20 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox7Q4KL20 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox7Q4KL20 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Obox7Q4KL20 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Obox7Q4KL20 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Obox7Q4KL20 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms