RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE5Q13069 117 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE13Q4V321 117 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TIRAPP58753 221 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM238C9JI98 176 aa13.27□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.27□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C9orf66Q5T8R8 295 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A0J9YXY3 114 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 K7ERU9 68 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APOMO95445 188 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPL24P83731 157 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPINK8P0C7L1 97 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00694P0DN24 101 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HERVK_113P63121 156 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFC1BP0CG36 223 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFC1P0CG37 223 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBX1P62877 108 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM243Q9BU79 118 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE2L6O14933 153 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 JMJD1CQ15652 2540 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 F8W1H4 67 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H7C423 109 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSPAN13O95857 204 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LYRM7Q5U5X0 104 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM101Q96IK0 257 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRLF1O75462 422 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FHL2Q14192 279 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZFAND6Q6FIF0 208 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRO1854Q9UHT4 67 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A4D1N5 150 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00242Q5T6M2 205 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H3BMG7 143 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOTCH2Q04721 2471 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COX6A2Q02221 97 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF151Q2KHN1 245 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A0B4J2C4 111 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LITAFQ99732 161 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPANXCQ9NY87 97 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A8MZ25 164 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TIMM17BO60830 172 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DEFB130BP0DP73 79 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DEFB130AP0DP74 79 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOTCH3Q9UM47 2321 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFA1O15239 70 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CITED1Q99966 193 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRSS2P07478 247 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 X6R8D5 127 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MIAQ16674 131 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VPS25Q9BRG1 176 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WFDC2Q14508 124 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERG28Q9UKR5 140 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 G3V4G9 280 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-33P01772 117 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSMB2P49721 201 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APOC4P55056 127 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SFTA2Q6UW10 78 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IFITM1P13164 125 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE6Q13070 117 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF183Q96D59 192 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRO0461Q9UI25 63 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LYRM9A8MSI8 78 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms