RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trav7-4A0A075B6C1 113 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Foxf2O54743 446 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trav7d-4Q5R1H9 113 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bhlha15Q9QYC3 197 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sfrp4Q9Z1N6 351 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm9944Q8C559 102 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mrps11Q9DCA2 191 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 1700020N15RikL7MTX3 112 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mllt11P97783 90 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccl12Q62401 104 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prr14lE9Q7C4 1971 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Glrx5Q80Y14 152 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tomm7Q9D173 55 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 A0A1Y7VMQ4 148 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 E430018J23RikE9PZQ8 461 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm10020E9QAZ2 204 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Otx1P80205 355 aa12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rpl15Q9CZM2 204 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Psmg4P0C7N9 123 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rpl23P62830 140 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NrepQ07475 68 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Col4a5Q63ZW6 1691 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ly6g6fB2RXM6 300 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf217D3YYI7 515 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ube2d2bQ6ZWY6 147 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ndufa11Q9D8B4 141 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igkv14-130A0A0G2JF45 117 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Umad1E0CX23 159 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cacng7P62956 275 aa12.66□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igh-3P01867 404 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Urb1Q571H0 2274 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Defa-rs7P50715 91 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 C1ql4Q4ZJM9 238 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 F11rO88792 300 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ApohQ01339 345 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rhno1Q8K3A4 235 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm10762Q9CZN6 115 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 OtofQ9ESF1 1997 aa12.65□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Foxr2Q3UM89 302 aa12.65□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm13030A2APQ6 143 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cacna1bO55017 2327 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trbv13-3A0A0B4J1H2 113 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igkv4-51A0N8I8 119 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sap30O88574 220 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc25a15Q9WVD5 301 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igkv14-126A0A075B5K0 117 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm29644A0A087WPG2 191 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Efnb3O35393 340 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ucp1P12242 307 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp36P22893 319 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SeleQ00690 612 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vdac2Q60930 295 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv1-34A0A075B5V2 117 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 EsdQ9R0P3 282 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ralgapa1Q6GYP7 2035 aa12.64□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hoxa5P09021 270 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pax1P09084 446 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmprss12Q3V0Q7 336 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q80X32 188 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv1-26A0A075B5V0 117 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm10130F6ZHM5 101 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igh-VJ558P01758 117 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pax9P47242 342 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Znf474Q6V5K9 347 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 LfngO09010 378 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Saxo2Q8BQB6 394 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Anapc10Q8K2H6 185 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dkk2Q9QYZ8 259 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nat6Q9R123 314 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr748E9Q9Z0 307 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Foxs1Q61574 329 aa12.63□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hils1Q9QYL0 170 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trbv31A0A075B5J5 111 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cphx2Q8BX39 182 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q8CF25 301 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SostQ99P68 211 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 P01655 112 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TcraP01849 138 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TirapQ99JY1 241 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GlmpQ9JHJ3 404 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ascl2O35885 263 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Scgb1b19F6WYW0 93 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Defa4P28311 92 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Erg28Q9ERY9 140 aa12.62□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm12845A0A0N4SUM5 588 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr779E9PUS9 130 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 A0A1Y7VLU2 103 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CrygsO35486 178 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q4KKZ1 196 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ovol2Q8CIV7 274 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Znf22Q9ERU3 237 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PpyP10601 100 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa12.61□□□□□ -0.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.4 ms