Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Pax1P09084 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Pax1P09084 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Pax1P09084 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pax1P09084 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Pax1P09084 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pax1P09084 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Pax1P09084 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Pax1P09084 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Pax1P09084 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Pax1P09084 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Pax1P09084 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Pax1P09084 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Pax1P09084 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Pax1P09084 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Pax1P09084 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Pax1P09084 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Pax1P09084 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Pax1P09084 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Pax1P09084 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
Pax1P09084 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Pax1P09084 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Pax1P09084 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Pax1P09084 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Pax1P09084 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Pax1P09084 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Pax1P09084 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Pax1P09084 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Pax1P09084 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Pax1P09084 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Pax1P09084 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Pax1P09084 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Pax1P09084 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Pax1P09084 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Pax1P09084 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Pax1P09084 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Pax1P09084 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Pax1P09084 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,87■■□□□ 1,41
Pax1P09084 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Pax1P09084 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Pax1P09084 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Pax1P09084 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Pax1P09084 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Pax1P09084 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Pax1P09084 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Pax1P09084 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Pax1P09084 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Pax1P09084 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Pax1P09084 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Pax1P09084 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Pax1P09084 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,35
Pax1P09084 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Pax1P09084 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Pax1P09084 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Pax1P09084 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Pax1P09084 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Pax1P09084 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
Pax1P09084 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Pax1P09084 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Pax1P09084 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Pax1P09084 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Pax1P09084 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Pax1P09084 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Pax1P09084 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Pax1P09084 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Pax1P09084 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
Pax1P09084 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Pax1P09084 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Pax1P09084 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Pax1P09084 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Pax1P09084 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Pax1P09084 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Pax1P09084 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Pax1P09084 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Pax1P09084 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Pax1P09084 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Pax1P09084 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Pax1P09084 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
Pax1P09084 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Pax1P09084 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Pax1P09084 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Pax1P09084 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Pax1P09084 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Pax1P09084 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Pax1P09084 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Pax1P09084 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Pax1P09084 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Pax1P09084 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Pax1P09084 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Pax1P09084 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Pax1P09084 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Pax1P09084 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Pax1P09084 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Pax1P09084 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Pax1P09084 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Pax1P09084 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Pax1P09084 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Pax1P09084 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Pax1P09084 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Pax1P09084 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms