Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
OtofQ9ESF1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
OtofQ9ESF1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
OtofQ9ESF1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
OtofQ9ESF1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
OtofQ9ESF1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
OtofQ9ESF1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
OtofQ9ESF1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
OtofQ9ESF1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
OtofQ9ESF1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
OtofQ9ESF1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
OtofQ9ESF1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
OtofQ9ESF1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
OtofQ9ESF1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
OtofQ9ESF1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
OtofQ9ESF1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
OtofQ9ESF1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
OtofQ9ESF1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
OtofQ9ESF1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
OtofQ9ESF1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
OtofQ9ESF1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
OtofQ9ESF1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
OtofQ9ESF1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
OtofQ9ESF1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
OtofQ9ESF1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
OtofQ9ESF1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
OtofQ9ESF1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
OtofQ9ESF1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
OtofQ9ESF1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
OtofQ9ESF1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
OtofQ9ESF1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
OtofQ9ESF1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
OtofQ9ESF1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
OtofQ9ESF1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
OtofQ9ESF1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
OtofQ9ESF1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
OtofQ9ESF1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
OtofQ9ESF1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
OtofQ9ESF1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
OtofQ9ESF1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
OtofQ9ESF1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
OtofQ9ESF1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
OtofQ9ESF1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
OtofQ9ESF1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
OtofQ9ESF1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
OtofQ9ESF1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
OtofQ9ESF1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
OtofQ9ESF1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
OtofQ9ESF1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
OtofQ9ESF1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
OtofQ9ESF1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
OtofQ9ESF1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
OtofQ9ESF1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
OtofQ9ESF1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
OtofQ9ESF1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OtofQ9ESF1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
OtofQ9ESF1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
OtofQ9ESF1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
OtofQ9ESF1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OtofQ9ESF1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
OtofQ9ESF1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OtofQ9ESF1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
OtofQ9ESF1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OtofQ9ESF1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OtofQ9ESF1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OtofQ9ESF1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OtofQ9ESF1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
OtofQ9ESF1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
OtofQ9ESF1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OtofQ9ESF1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OtofQ9ESF1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
OtofQ9ESF1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OtofQ9ESF1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
OtofQ9ESF1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
OtofQ9ESF1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OtofQ9ESF1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
OtofQ9ESF1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OtofQ9ESF1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OtofQ9ESF1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OtofQ9ESF1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OtofQ9ESF1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OtofQ9ESF1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OtofQ9ESF1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OtofQ9ESF1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OtofQ9ESF1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
OtofQ9ESF1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OtofQ9ESF1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OtofQ9ESF1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OtofQ9ESF1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
OtofQ9ESF1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OtofQ9ESF1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
OtofQ9ESF1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
OtofQ9ESF1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OtofQ9ESF1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
OtofQ9ESF1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OtofQ9ESF1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OtofQ9ESF1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OtofQ9ESF1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OtofQ9ESF1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
OtofQ9ESF1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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