RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.55■■■□□ 2
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa24.52■■□□□ 1.52
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.43■■□□□ 1.5
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gab3Q8BSM5 595 aa24.07■■□□□ 1.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ube2uB1AUC4 352 aa24.06■■□□□ 1.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wdr66E9Q743 1299 aa24.03■■□□□ 1.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zeb1Q64318 1117 aa24■■□□□ 1.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Npm2Q80W85 207 aa23.86■■□□□ 1.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Myt1lP97500 1187 aa23.72■■□□□ 1.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NischQ80TM9 1593 aa23.71■■□□□ 1.39
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trim41Q5NCC3 630 aa23.66■■□□□ 1.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Il27Q8K3I6 234 aa22.98■■□□□ 1.27
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.87■■□□□ 1.25
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NefmP08553 848 aa22.6■■□□□ 1.21
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Abcc9P70170 1546 aa22.59■■□□□ 1.21
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa22.55■■□□□ 1.2
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.5■■□□□ 1.19
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Neurod1Q60867 357 aa22.45■■□□□ 1.18
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Amer1Q7TS75 1132 aa22.41■■□□□ 1.18
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stra8P70278 393 aa22.39■■□□□ 1.17
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CenpbP27790 599 aa22.38■■□□□ 1.17
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa22.28■■□□□ 1.16
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Os9Q8K2C7 672 aa22.25■■□□□ 1.15
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HrcG5E8J6 738 aa22.22■■□□□ 1.15
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rtl1Q7M732 1744 aa22.21■■□□□ 1.15
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NclP09405 707 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.08■■□□□ 1.13
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.05■■□□□ 1.12
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa21.99■■□□□ 1.11
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa21.9■■□□□ 1.1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lmod2Q3UHZ5 550 aa21.88■■□□□ 1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pcgf6Q99NA9 353 aa21.88■■□□□ 1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NeflP08551 543 aa21.84■■□□□ 1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TonslQ6NZL6 1363 aa21.84■■□□□ 1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mier1Q5UAK0 511 aa21.74■■□□□ 1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa21.73■■□□□ 1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chic1Q8CBW7 227 aa21.73■■□□□ 1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 4933416C03RikQ3V063 378 aa21.71■■□□□ 1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm13697A2AK42 830 aa21.69■■□□□ 1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zbtb4Q5F293 982 aa21.68■■□□□ 1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tnnt3Q9QZ47 272 aa21.65■■□□□ 1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Erich6D3Z6S9 713 aa21.58■■□□□ 1.04
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp1b4Q99ME6 356 aa21.53■■□□□ 1.04
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa21.5■■□□□ 1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plppr3Q7TPB0 716 aa21.46■■□□□ 1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa21.44■■□□□ 1.02
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Abcc8B2RUS7 1588 aa21.39■■□□□ 1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa21.32■■□□□ 1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nlrp6Q91WS2 869 aa21.31■■□□□ 1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Eid3Q3V124 375 aa21.29■■□□□ 1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm13695A2AK44 830 aa21.28■■□□□ 1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Polr3glQ8R0C0 218 aa21.26■□□□□ 0.99
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ClspnQ80YR7 1315 aa21.16■□□□□ 0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.15■□□□□ 0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Clip1Q922J3 1391 aa21.15■□□□□ 0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ArxO35085 564 aa21.05■□□□□ 0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chic2Q9D9G3 165 aa21.02■□□□□ 0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa21.01■□□□□ 0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Csrnp3P59055 597 aa21■□□□□ 0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm38655A0A286YDK6 273 aa21■□□□□ 0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Anp32aO35381 247 aa20.88■□□□□ 0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 DaxxO35613 739 aa20.88■□□□□ 0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Myt1Q8CFC2 1127 aa20.87■□□□□ 0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa20.86■□□□□ 0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cep164Q5DU05 1446 aa20.84■□□□□ 0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rtl5Q5DTT4 599 aa20.84■□□□□ 0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sall2Q9QX96 1004 aa20.81■□□□□ 0.92
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dcaf1Q80TR8 1506 aa20.79■□□□□ 0.92
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BlmO88700 1416 aa20.76■□□□□ 0.91
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 P3h3Q8CG70 732 aa20.75■□□□□ 0.91
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccer2J3QPU5 274 aa20.66■□□□□ 0.9
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trim26Q99PN3 545 aa20.59■□□□□ 0.89
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa20.58■□□□□ 0.88
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Setd5Q5XJV7 1441 aa20.55■□□□□ 0.88
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rgl3Q3UYI5 709 aa20.55■□□□□ 0.88
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Calr4Q3TQS0 420 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mrs2Q5NCE8 434 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.9 ms