RNA–Protein interactions for RNA: YPR172W

YPR172W, Transcript of Putative pyridoxal 5'-phosphate synthase, yeast

Gene YPR172W, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR172W	YPR172W	BI2	P03873	423 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	PCK1	P10963	549 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	ATP12	P22135	325 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	CDC5	P32562	705 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	YEL076C	P39971	216 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	RAD26	P40352	1085 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	SAE2	P46946	345 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	YNL058C	P53947	316 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.86	□□□□□ -1.79	not detected
YPR172W	YPR172W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	ASK1	P35734	292 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	SDH8	P38345	138 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	STB2	P46679	850 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	IRC8	P47046	822 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	MDR1	P53258	950 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	HRD3	Q05787	833 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	TPO3	Q06451	622 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	CRC1	Q12289	327 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	YPL071C	Q02864	156 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	ENT2	Q05785	613 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YPR172W	YPR172W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	LAS21	P40367	830 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	NIT2	P47016	307 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	MNT2	P53059	558 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	CYK3	Q07533	885 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	DAL3	P32459	195 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	EMP65	P40085	556 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	CFD1	P40558	293 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	CIR1	P42940	261 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	YNL092W	P53934	400 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	DOS2	P54858	310 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	MRPL1	Q04599	285 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	YOR378W	Q08902	515 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	MAM1	P40065	302 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	YIL024C	P40543	189 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	IRC7	P43623	340 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	SPC105	P53148	917 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	COG2	P53271	262 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	HOL1	P53389	586 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	RAD33	Q04231	177 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	TRE2	Q08693	809 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	HOS1	Q12214	470 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	YPR089W	O13585	888 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	ARG1	P22768	420 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	PLC1	P32383	869 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	GDA1	P32621	518 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	MEP2	P41948	499 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	COS12	P53053	380 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	SLD3	P53135	668 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	COQ3	P27680	312 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	FTH1	P38310	465 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	UBP12	P39538	1254 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	STL1	P39932	569 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	PEX15	Q08215	383 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	URA3	P03962	267 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	MGM1	P32266	881 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	PXL1	P36166	706 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	MAD2	P40958	196 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	YNR071C	P53757	342 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	HER1	Q12276	1246 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YPR172W	YPR172W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	MAK32	P23060	363 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	MTG2	P38860	518 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	EAF5	P39995	279 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	GSM1	P42950	618 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	TRI1	Q05024	226 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	LCB4	Q12246	624 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	AMD2	P22580	549 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	YBR071W	P38243	211 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YPR172W	YPR172W	LNP1	P38878	278 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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