RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FPR4	YLR449W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FPR4	YLR449W	SHE9	Q04172	456 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FPR4	YLR449W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.33	□□□□□ -0.28	not detected
FPR4	YLR449W	YAT2	P40017	923 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YJL107C	P42947	387 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	VPS25	P47142	202 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YNL058C	P53947	316 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	PMT7	Q06644	662 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	AAD15	Q08361	143 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.33	□□□□□ -0.28	not detected
FPR4	YLR449W	URA10	P30402	227 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	HSP78	P33416	811 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	TAF6	P53040	516 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	NUT1	P53114	1132 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SPP1	Q03012	353 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	ADI1	Q03677	179 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YET3	Q07451	203 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SLP1	Q12232	587 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	LCB4	Q12246	624 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	ARP7	Q12406	477 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.31	□□□□□ -0.28	not detected
FPR4	YLR449W	AMS1	P22855	1083 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YIH1	P25637	258 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	ADK2	P26364	225 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SMI1	P32566	505 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	HSM3	P38348	480 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YGR127W	P53275	312 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	MET14	Q02196	202 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	ARA2	Q04212	335 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.31	□□□□□ -0.28	not detected
FPR4	YLR449W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YLR053C	Q12026	108 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	HRT3	Q12347	344 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	AVT3	P36062	692 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	RIM4	P38741	713 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	VTC4	P47075	721 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	RCF2	P53721	224 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YMR160W	Q03823	816 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YML083C	Q04526	418 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.3	□□□□□ -0.28	not detected
FPR4	YLR449W	GID7	P25569	745 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	AIM26	P32858	118 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	BEM3	P32873	1128 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YFL052W	P43551	465 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	INP2	Q03824	705 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	PMR1	P13586	950 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	UTR2	P32623	467 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	COY1	P34237	679 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	PEX5	P35056	612 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YBP1	P38315	674 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	YEL028W	P39989	153 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SNG1	P46950	547 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	BIO4	P53630	237 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SPC24	Q04477	213 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	SPE4	Q12455	300 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FPR4	YLR449W	INO1	P11986	533 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	MRE11	P32829	692 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	ATM1	P40416	690 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	MAF1	P41910	395 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	RTT101	P47050	842 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	ARP9	Q05123	467 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	BAS1	P22035	811 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	ECM13	P38195	257 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	SIF2	P38262	535 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FPR4	YLR449W	TEP1	P53916	434 aa		13.26	□□□□□ -0.29

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