RNA–Protein interactions for RNA: YBR293W

VBA2, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA2, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA2	YBR293W	VPS51	P36116	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	UIP5	P36137	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	GLG1	P36143	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PPS1	P38148	807 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YBR032W	P38223	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SWC5	P38326	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YHR112C	P38716	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPH1	P39956	796 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PRK1	P40494	810 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	LYS14	P40971	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YFH7	P43591	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MIG2	P53035	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TAF6	P53040	516 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	LIF1	P53150	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PIB2	P53191	635 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YNR040W	P53736	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	OSH6	Q02201	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TAF12	Q03761	539 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	URC2	Q04411	772 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	NSE3	Q05541	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	GLO2	Q05584	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ALE1	Q08548	619 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	BAG7	Q12128	409 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CEX1	Q12453	761 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	CIT2	P08679	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	STF2	P16965	84 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	CLB3	P24870	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	OCA4	P25366	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	ACH1	P32316	526 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	PFF1	P38244	976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	SLM4	P38247	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	YBR225W	P38321	900 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	SRB7	P47822	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	RMR1	P53060	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	ZIP2	P53061	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	USE1	P53146	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	RTS3	P53289	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	RAD30	Q04049	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	SPR28	Q04921	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	ADY3	Q07732	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	PIN2	Q12057	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	VPS54	Q12071	889 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	MED4	Q12343	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	RAD61	Q99359	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	CMP2	P14747	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	DAP2	P18962	818 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	OPI1	P21957	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
VBA2	YBR293W	TFC4	P33339	1025 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	RPC25	P35718	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	ETR1	P38071	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	DYS1	P38791	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	MTG2	P38860	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	STN1	P38960	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	TMN3	P40071	706 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	YER186C	P40101	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	IRC5	P43610	853 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	NMD5	P46970	1048 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	PRY1	P47032	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	YJR008W	P47085	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	ALG12	P53730	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	ORC3	P54790	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	SHR3	Q02774	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	SMP3	Q04174	516 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	ENT2	Q05785	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	DXO1	Q06349	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	VPS36	Q06696	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA2	YBR293W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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