RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446903.5

TNS1-210, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-210ENST00000446903 LTBP1Q14766 1721 aa16.15■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 CPLX1O14810 134 aa16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 NTRK3Q16288 839 aa16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 PGBD1Q96JS3 809 aa16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 MTA3Q9BTC8 594 aa16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 JAG2Q9Y219 1238 aa16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 LAMB1P07942 1786 aa16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.14■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ZBTB43O43298 467 aa16.14■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.14■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 AKT1S1Q96B36 256 aa16.14■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.14■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 PLSCR1O15162 318 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 LIG1P18858 919 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 TERF1P54274 439 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 MICU3Q86XE3 530 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 FGRP09769 529 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 RGS22Q8NE09 1264 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 C8orf76Q96K31 380 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 MYL10Q9BUA6 226 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CFAP45Q9UL16 551 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CTR9Q6PD62 1173 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 USP28Q96RU2 1077 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 SEC23AQ15436 765 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ATL3Q6DD88 541 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 TOMM22Q9NS69 142 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 IGSF3O75054 1194 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 BBOX1O75936 387 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CDKL5O76039 1030 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ATP2B4P23634 1241 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 EVX2Q03828 476 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 GRIK5Q16478 980 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 AIFM3Q96NN9 605 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CCDC69A6NI79 296 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 UFL1O94874 794 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 WTAPQ15007 396 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 PHKBQ93100 1093 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 USP25Q9UHP3 1055 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 USP17L12C9JPN9 530 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 USP17L21D6R901 530 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ESR2Q92731 530 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 KIF28PB7ZC32 967 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 APBA3O96018 575 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 GGA1Q9UJY5 639 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 STK36Q9NRP7 1315 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 IL1R1P14778 569 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 RCAN1P53805 252 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 ALG1Q9BT22 464 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 CD209Q9NNX6 404 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 POLLQ9UGP5 575 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 SBK1Q52WX2 424 aa16.08■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 TMTC2Q8N394 836 aa16.08■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
TNS1-210ENST00000446903 TNKSO95271 1327 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 4851.7 ms