RNA–Protein interactions for RNA: YOL051W

GAL11, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene GAL11, Length 3,246 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAL11	YOL051W	YPP1	P46951	817 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	MMS1	Q06211	1407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	ENV11	P53246	860 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	YPK9	Q12697	1472 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	MYO4	P32492	1471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	SWE1	P32944	819 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	RAD26	P40352	1085 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	SMC4	Q12267	1418 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GAL11	YOL051W	PCT1	P13259	424 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	VPS15	P22219	1454 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	PAF1	P38351	445 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	MHP1	P43638	1398 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	DNF1	P32660	1571 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	PDS5	Q04264	1277 aa		5	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	NUP159	P40477	1460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GAL11	YOL051W	MSP1	P28737	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	YIR014W	P40570	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	RLF2	Q12495	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	ATG2	P53855	1592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	CLB5	P30283	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	GCN2	P15442	1659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	QCR6	P00127	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	YGL081W	P53156	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	CDC45	Q08032	650 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	TEA1	P47988	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	RPO31	P04051	1460 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	YBT1	P32386	1661 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GAL11	YOL051W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	CKB1	P43639	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TRK1	P12685	1235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	MDG1	P53885	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	DAL5	P15365	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	MCM2	P29469	868 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TAF5	P38129	798 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	EDE1	P34216	1381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	RSC1	P53236	928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	RAD2	P07276	1031 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	RTG3	P38165	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	MSH3	P25336	1018 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	MED8	P38304	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	SMC3	P47037	1230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	SPC110	P32380	944 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	SIC1	P38634	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	ECM1	P39715	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	POL32	P47110	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	DOS2	P54858	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	TPM2	P40414	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	DSN1	P40568	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GAL11	YOL051W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
GAL11	YOL051W	RKM3	P38222	552 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GAL11	YOL051W	LCD1	Q04377	747 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GAL11	YOL051W	RIM101	P33400	625 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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