RNA–Protein interactions for RNA: YBR003W

COQ1, Transcript of Hexaprenyl pyrophosphate synthetase, yeastyeast

Gene COQ1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COQ1YBR003W VTH1P40438 1549 aa10.01□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W VTH2P40890 1549 aa10.01□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TY1B-ER2Q03619 1755 aa10□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TY1B-MR1Q04214 1755 aa10□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TY1B-NL1Q12112 1755 aa10□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TY1B-GR1Q12141 1755 aa10□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TY1B-BLQ12490 1755 aa10□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W TSC11P40061 1430 aa9.99□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W DNF1P32660 1571 aa9.99□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W STH1P32597 1359 aa9.98□□□□□ -0.81
COQ1YBR003W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
COQ1YBR003W TRM732Q03496 1420 aa9.94□□□□□ -0.82
COQ1YBR003W NTE1Q04958 1679 aa9.94□□□□□ -0.82
COQ1YBR003W ULS1Q08562 1619 aa9.93□□□□□ -0.82
COQ1YBR003W TAF7Q05021 590 aa9.92□□□□□ -0.82
COQ1YBR003W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
COQ1YBR003W SNT2P53127 1403 aa9.87□□□□□ -0.83
COQ1YBR003W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W CDC27P38042 758 aa9.82□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W IFH1P39520 1085 aa9.82□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W NUP159P40477 1460 aa9.82□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W MET5P47169 1442 aa9.79□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W YRF1-1P0CX20 1796 aa9.79□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W YRF1-5P0CX21 1796 aa9.79□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W YRF1-8P0CX22 1796 aa9.79□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
COQ1YBR003W RTT106P40161 455 aa9.77□□□□□ -0.85
COQ1YBR003W IRC20Q06554 1556 aa9.76□□□□□ -0.85
COQ1YBR003W TY3B-GQ99315 1547 aa9.75□□□□□ -0.85
COQ1YBR003W YBT1P32386 1661 aa9.74□□□□□ -0.85
COQ1YBR003W SPT21P35209 758 aa9.73□□□□□ -0.85
COQ1YBR003W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
COQ1YBR003W VPS15P22219 1454 aa9.71□□□□□ -0.86
COQ1YBR003W SPO14P36126 1683 aa9.71□□□□□ -0.86
COQ1YBR003W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
COQ1YBR003W NUP170P38181 1502 aa9.69□□□□□ -0.86
COQ1YBR003W PDR12Q02785 1511 aa9.67□□□□□ -0.86
COQ1YBR003W CAT8P39113 1433 aa9.66□□□□□ -0.86
COQ1YBR003W GDB1Q06625 1536 aa9.66□□□□□ -0.86
COQ1YBR003W MET10P39692 1035 aa9.65□□□□□ -0.87
COQ1YBR003W PDR10P51533 1564 aa9.63□□□□□ -0.87
COQ1YBR003W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
COQ1YBR003W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
COQ1YBR003W SSM4P40318 1319 aa9.59□□□□□ -0.87
COQ1YBR003W LTE1P07866 1435 aa9.58□□□□□ -0.88
COQ1YBR003W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
COQ1YBR003W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
COQ1YBR003W BUD3P25558 1636 aa9.54□□□□□ -0.88
COQ1YBR003W IQG1Q12280 1495 aa9.52□□□□□ -0.89
COQ1YBR003W CKB1P43639 278 aa9.52□□□□□ -0.89
COQ1YBR003W SRB8P25648 1427 aa9.52□□□□□ -0.89
COQ1YBR003W HOP09932 586 aa9.49□□□□□ -0.89
COQ1YBR003W DCD1P06773 312 aa9.48□□□□□ -0.89
COQ1YBR003W TFC8Q12308 588 aa9.48□□□□□ -0.89
COQ1YBR003W YSP2Q06681 1438 aa9.46□□□□□ -0.89
COQ1YBR003W DOP1Q03921 1698 aa9.45□□□□□ -0.9
COQ1YBR003W DRS2P39524 1355 aa9.45□□□□□ -0.9
COQ1YBR003W BNI1P41832 1953 aa9.44□□□□□ -0.9
COQ1YBR003W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
COQ1YBR003W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
COQ1YBR003W GCN2P15442 1659 aa9.4□□□□□ -0.9
COQ1YBR003W MMS1Q06211 1407 aa9.4□□□□□ -0.9
COQ1YBR003W TRM3Q07527 1436 aa9.4□□□□□ -0.9
COQ1YBR003W ITT1Q04638 464 aa9.39□□□□□ -0.91
COQ1YBR003W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
COQ1YBR003W BNR1P40450 1375 aa9.38□□□□□ -0.91
COQ1YBR003W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
COQ1YBR003W YOR093CQ12275 1648 aa9.3□□□□□ -0.92
COQ1YBR003W SCY1P53009 804 aa9.28□□□□□ -0.92
COQ1YBR003W RIM101P33400 625 aa9.27□□□□□ -0.93
COQ1YBR003W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
COQ1YBR003W DNF2Q12675 1612 aa9.25□□□□□ -0.93
COQ1YBR003W VMR1P38735 1592 aa9.24□□□□□ -0.93
COQ1YBR003W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COQ1YBR003W IML1P47170 1584 aa9.19□□□□□ -0.94
COQ1YBR003W NOP7P53261 605 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
COQ1YBR003W PAF1P38351 445 aa9.17□□□□□ -0.94
COQ1YBR003W BCH2P36122 765 aa9.16□□□□□ -0.94
COQ1YBR003W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
COQ1YBR003W PDR11P40550 1411 aa9.14□□□□□ -0.95
COQ1YBR003W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
COQ1YBR003W URN1Q06525 465 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
COQ1YBR003W RAV1P47104 1357 aa9.11□□□□□ -0.95
COQ1YBR003W TGL3P40308 642 aa9.11□□□□□ -0.95
COQ1YBR003W IPL1P38991 367 aa9.08□□□□□ -0.96
COQ1YBR003W DNF3Q12674 1656 aa9.08□□□□□ -0.96
COQ1YBR003W TYS1P36421 394 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
COQ1YBR003W YAP3P38749 330 aa9.07□□□□□ -0.96
COQ1YBR003W RTC1Q08281 1341 aa9.07□□□□□ -0.96
COQ1YBR003W POL5P39985 1022 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
COQ1YBR003W NUP192P47054 1683 aa9.05□□□□□ -0.96
COQ1YBR003W ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
COQ1YBR003W HAP1P0CE41 1502 aa9.01□□□□□ -0.97
COQ1YBR003W TAF5P38129 798 aa8.98□□□□□ -0.97
COQ1YBR003W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
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