RNA–Protein interactions for RNA: HRA1

HRA1, Non-protein-coding RNA, yeast

Gene HRA1, Length 564 nt, Biotype ncRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRA1	HRA1	VTH1	P40438	1549 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	VTH2	P40890	1549 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HRA1	HRA1	DNF2	Q12675	1612 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HRA1	HRA1	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
HRA1	HRA1	MYO4	P32492	1471 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HRA1	HRA1	NUP170	P38181	1502 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HRA1	HRA1	SNT2	P53127	1403 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HRA1	HRA1	MET10	P39692	1035 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HRA1	HRA1	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
HRA1	HRA1	RTT106	P40161	455 aa		13	□□□□□ -0.33
HRA1	HRA1	STH1	P32597	1359 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HRA1	HRA1	ULS1	Q08562	1619 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HRA1	HRA1	SPO14	P36126	1683 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HRA1	HRA1	YTA7	P40340	1379 aa		12.94	□□□□□ -0.34
HRA1	HRA1	YOR093C	Q12275	1648 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HRA1	HRA1	TRM3	Q07527	1436 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HRA1	HRA1	PDR12	Q02785	1511 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HRA1	HRA1	DOP1	Q03921	1698 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HRA1	HRA1	IQG1	Q12280	1495 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HRA1	HRA1	PDR10	P51533	1564 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HRA1	HRA1	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
HRA1	HRA1	GDB1	Q06625	1536 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HRA1	HRA1	BUD3	P25558	1636 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HRA1	HRA1	MLP2	P40457	1679 aa		12.7	□□□□□ -0.38
HRA1	HRA1	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
HRA1	HRA1	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
HRA1	HRA1	YAP3	P38749	330 aa		12.59	□□□□□ -0.39
HRA1	HRA1	DNF3	Q12674	1656 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HRA1	HRA1	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
HRA1	HRA1	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
HRA1	HRA1	TAF7	Q05021	590 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HRA1	HRA1	MAK10	Q02197	733 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HRA1	HRA1	IFH1	P39520	1085 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HRA1	HRA1	BNR1	P40450	1375 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HRA1	HRA1	TY3B-G	Q99315	1547 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HRA1	HRA1	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HRA1	HRA1	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HRA1	HRA1	CAT8	P39113	1433 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HRA1	HRA1	CKB1	P43639	278 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HRA1	HRA1	YSP2	Q06681	1438 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HRA1	HRA1	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
HRA1	HRA1	YMR196W	Q04336	1088 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HRA1	HRA1	USO1	P25386	1790 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HRA1	HRA1	THI12	P42883	340 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HRA1	HRA1	THI5	P43534	340 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HRA1	HRA1	THI11	P47183	340 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HRA1	HRA1	THI13	Q07748	340 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HRA1	HRA1	YBT1	P32386	1661 aa		12.23	□□□□□ -0.45
HRA1	HRA1	IPL1	P38991	367 aa		12.19	□□□□□ -0.46
HRA1	HRA1	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
HRA1	HRA1	HAP1	P0CE41	1502 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HRA1	HRA1	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HRA1	HRA1	SRB8	P25648	1427 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HRA1	HRA1	IML1	P47170	1584 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HRA1	HRA1	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
HRA1	HRA1	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HRA1	HRA1	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HRA1	HRA1	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
HRA1	HRA1	VMR1	P38735	1592 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HRA1	HRA1	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HRA1	HRA1	APP1	P53933	587 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HRA1	HRA1	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
HRA1	HRA1	PRI1	P10363	409 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HRA1	HRA1	PTP3	P40048	928 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HRA1	HRA1	MRX12	P47084	519 aa		11.8	□□□□□ -0.52
HRA1	HRA1	RIA1	P53893	1110 aa		11.79	□□□□□ -0.52
HRA1	HRA1	KRE5	P22023	1365 aa		11.77	□□□□□ -0.53
HRA1	HRA1	YMR074C	Q04773	145 aa		11.76	□□□□□ -0.53
HRA1	HRA1	PDR11	P40550	1411 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HRA1	HRA1	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
HRA1	HRA1	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
HRA1	HRA1	BCK1	Q01389	1478 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HRA1	HRA1	REB1	P21538	810 aa		11.71	□□□□□ -0.53
HRA1	HRA1	ENT1	Q12518	454 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HRA1	HRA1	ENV9	Q08651	330 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HRA1	HRA1	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HRA1	HRA1	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
HRA1	HRA1	CAB1	Q04430	367 aa		11.55	□□□□□ -0.56
HRA1	HRA1	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
HRA1	HRA1	GCN2	P15442	1659 aa		11.52	□□□□□ -0.57
HRA1	HRA1	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HRA1	HRA1	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HRA1	HRA1	PAF1	P38351	445 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HRA1	HRA1	RAD9	P14737	1309 aa		11.47	□□□□□ -0.57
HRA1	HRA1	UBP1	P25037	809 aa		11.46	□□□□□ -0.57
HRA1	HRA1	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
HRA1	HRA1	LEU3	P08638	886 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HRA1	HRA1	RAV1	P47104	1357 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HRA1	HRA1	NUP192	P47054	1683 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HRA1	HRA1	SSM4	P40318	1319 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HRA1	HRA1	TAF5	P38129	798 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HRA1	HRA1	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59

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