RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641936.1

TRIM16L-216, Transcript of tripartite motif containing 16 like, humanhuman

Gene TRIM16L, Length 2,048 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16L-216ENST00000641936 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.31■□□□□ 0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 WDR62O43379 1518 aa15.3■□□□□ 0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 GOLGA3Q08378 1498 aa15.29■□□□□ 0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.27■□□□□ 0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 CEP162Q5TB80 1403 aa15.26■□□□□ 0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.26■□□□□ 0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 KIF21BO75037 1637 aa15.25■□□□□ 0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 KIF27Q86VH2 1401 aa15.25■□□□□ 0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.24■□□□□ 0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 WDR97A6NE52 1622 aa15.2■□□□□ 0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 IFT140Q96RY7 1462 aa15.17■□□□□ 0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 IGF1RP08069 1367 aa15.14■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.12■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.12■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.11■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 PRXQ9BXM0 1461 aa15.11■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.09■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.09■□□□□ 0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.08■□□□□ 0
TRIM16L-216ENST00000641936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
TRIM16L-216ENST00000641936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
TRIM16L-216ENST00000641936 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
TRIM16L-216ENST00000641936 CLIP1P30622 1438 aa15.05■□□□□ 0
TRIM16L-216ENST00000641936 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.05■□□□□ 0
TRIM16L-216ENST00000641936 CUL7Q14999 1698 aa15.03■□□□□ -0
TRIM16L-216ENST00000641936 GRIN2BQ13224 1484 aa15.02■□□□□ -0
TRIM16L-216ENST00000641936 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.02□□□□□ -0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 PBRM1Q86U86 1689 aa15.02□□□□□ -0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.01□□□□□ -0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.99□□□□□ -0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TRIM16L-216ENST00000641936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.95□□□□□ -0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.93□□□□□ -0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 ADAMTS12P58397 1594 aa14.93□□□□□ -0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.93□□□□□ -0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.92□□□□□ -0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM16L-216ENST00000641936 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.88□□□□□ -0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 SYNJ2O15056 1496 aa14.85□□□□□ -0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 ARAP1Q96P48 1450 aa14.85□□□□□ -0.03
TRIM16L-216ENST00000641936 GRIN2AQ12879 1464 aa14.83□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 ARXQ96QS3 562 aa14.83□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.82□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 FBLN2P98095 1184 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 FKBP8Q14318 412 aa14.77□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.77□□□□□ -0.04
TRIM16L-216ENST00000641936 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 NUP160Q12769 1436 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 OSCARQ8IYS5 282 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 IQGAP2Q13576 1575 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 BCANQ96GW7 911 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 CEP170Q5SW79 1584 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 CHD1O14646 1710 aa14.72□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.71□□□□□ -0.05
TRIM16L-216ENST00000641936 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 SAMD9Q5K651 1589 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 MIER1Q8N108 512 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 PLCB2Q00722 1185 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 MAP3K1Q13233 1512 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 P3H3Q8IVL6 736 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-216ENST00000641936 JPH4Q96JJ6 628 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 DISP1Q96F81 1524 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 TIAM1Q13009 1591 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-216ENST00000641936 FMN1Q68DA7 1419 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-216ENST00000641936 KIAA0556O60303 1618 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-216ENST00000641936 MSH5O43196 834 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-216ENST00000641936 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-216ENST00000641936 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-216ENST00000641936 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM16L-216ENST00000641936 SHROOM2Q13796 1616 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-216ENST00000641936 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms